Protein–RNA interactions for Protein: Q6EDY6

Carmil1, F-actin-uncapping protein LRRC16A, mousemouse

Predictions only

Length 1,374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Carmil1Q6EDY6 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Carmil1Q6EDY6 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Carmil1Q6EDY6 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Carmil1Q6EDY6 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Carmil1Q6EDY6 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Carmil1Q6EDY6 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
Carmil1Q6EDY6 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC30.98■■■□□ 2.55
Carmil1Q6EDY6 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Carmil1Q6EDY6 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Carmil1Q6EDY6 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Carmil1Q6EDY6 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Carmil1Q6EDY6 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Carmil1Q6EDY6 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC30.97■■■□□ 2.55
Carmil1Q6EDY6 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC30.97■■■□□ 2.55
Carmil1Q6EDY6 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Carmil1Q6EDY6 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC30.97■■■□□ 2.55
Carmil1Q6EDY6 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Carmil1Q6EDY6 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Carmil1Q6EDY6 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Carmil1Q6EDY6 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Carmil1Q6EDY6 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Carmil1Q6EDY6 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Carmil1Q6EDY6 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC30.96■■■□□ 2.55
Carmil1Q6EDY6 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Carmil1Q6EDY6 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.55
Carmil1Q6EDY6 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.55
Carmil1Q6EDY6 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
Carmil1Q6EDY6 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.55
Carmil1Q6EDY6 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
Carmil1Q6EDY6 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.54
Carmil1Q6EDY6 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
Carmil1Q6EDY6 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC30.94■■■□□ 2.54
Carmil1Q6EDY6 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC30.94■■■□□ 2.54
Carmil1Q6EDY6 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC30.94■■■□□ 2.54
Carmil1Q6EDY6 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Carmil1Q6EDY6 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
Carmil1Q6EDY6 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC30.93■■■□□ 2.54
Carmil1Q6EDY6 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Carmil1Q6EDY6 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Carmil1Q6EDY6 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC30.92■■■□□ 2.54
Carmil1Q6EDY6 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC30.92■■■□□ 2.54
Carmil1Q6EDY6 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
Carmil1Q6EDY6 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Carmil1Q6EDY6 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Carmil1Q6EDY6 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
Carmil1Q6EDY6 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Carmil1Q6EDY6 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Carmil1Q6EDY6 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Carmil1Q6EDY6 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Carmil1Q6EDY6 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC30.91■■■□□ 2.54
Carmil1Q6EDY6 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
Carmil1Q6EDY6 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Carmil1Q6EDY6 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
Carmil1Q6EDY6 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC30.9■■■□□ 2.54
Carmil1Q6EDY6 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
Carmil1Q6EDY6 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC30.89■■■□□ 2.54
Carmil1Q6EDY6 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC30.89■■■□□ 2.54
Carmil1Q6EDY6 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
Carmil1Q6EDY6 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.53
Carmil1Q6EDY6 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC30.88■■■□□ 2.53
Carmil1Q6EDY6 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
Carmil1Q6EDY6 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Carmil1Q6EDY6 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC30.88■■■□□ 2.53
Carmil1Q6EDY6 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Carmil1Q6EDY6 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC30.88■■■□□ 2.53
Carmil1Q6EDY6 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC30.88■■■□□ 2.53
Carmil1Q6EDY6 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
Carmil1Q6EDY6 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
Carmil1Q6EDY6 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
Carmil1Q6EDY6 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Carmil1Q6EDY6 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Carmil1Q6EDY6 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Carmil1Q6EDY6 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Carmil1Q6EDY6 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
Carmil1Q6EDY6 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC30.87■■■□□ 2.53
Carmil1Q6EDY6 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
Carmil1Q6EDY6 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC30.87■■■□□ 2.53
Carmil1Q6EDY6 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.87■■■□□ 2.53
Carmil1Q6EDY6 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Carmil1Q6EDY6 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Carmil1Q6EDY6 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Carmil1Q6EDY6 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Carmil1Q6EDY6 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC30.86■■■□□ 2.53
Carmil1Q6EDY6 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Carmil1Q6EDY6 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Carmil1Q6EDY6 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Carmil1Q6EDY6 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Carmil1Q6EDY6 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
Carmil1Q6EDY6 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC30.85■■■□□ 2.53
Carmil1Q6EDY6 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Carmil1Q6EDY6 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Carmil1Q6EDY6 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Carmil1Q6EDY6 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Carmil1Q6EDY6 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
Carmil1Q6EDY6 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC30.84■■■□□ 2.53
Carmil1Q6EDY6 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Carmil1Q6EDY6 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
Carmil1Q6EDY6 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Carmil1Q6EDY6 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
Carmil1Q6EDY6 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC30.84■■■□□ 2.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms