Protein–RNA interactions for Protein: Q6DIC0

Smarca2, Probable global transcription activator SNF2L2, mousemouse

Predictions only

Length 1,577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca2Q6DIC0 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
Smarca2Q6DIC0 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
Smarca2Q6DIC0 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
Smarca2Q6DIC0 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC35.21■■■■□ 3.23
Smarca2Q6DIC0 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC35.21■■■■□ 3.23
Smarca2Q6DIC0 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
Smarca2Q6DIC0 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC35.21■■■■□ 3.23
Smarca2Q6DIC0 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
Smarca2Q6DIC0 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
Smarca2Q6DIC0 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
Smarca2Q6DIC0 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC35.21■■■■□ 3.23
Smarca2Q6DIC0 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
Smarca2Q6DIC0 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
Smarca2Q6DIC0 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.21■■■■□ 3.23
Smarca2Q6DIC0 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
Smarca2Q6DIC0 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
Smarca2Q6DIC0 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC35.2■■■■□ 3.23
Smarca2Q6DIC0 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC35.2■■■■□ 3.23
Smarca2Q6DIC0 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC35.2■■■■□ 3.23
Smarca2Q6DIC0 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC35.2■■■■□ 3.23
Smarca2Q6DIC0 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC35.2■■■■□ 3.23
Smarca2Q6DIC0 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
Smarca2Q6DIC0 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
Smarca2Q6DIC0 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
Smarca2Q6DIC0 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
Smarca2Q6DIC0 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC35.18■■■■□ 3.22
Smarca2Q6DIC0 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
Smarca2Q6DIC0 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
Smarca2Q6DIC0 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
Smarca2Q6DIC0 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
Smarca2Q6DIC0 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
Smarca2Q6DIC0 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC35.17■■■■□ 3.22
Smarca2Q6DIC0 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
Smarca2Q6DIC0 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
Smarca2Q6DIC0 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
Smarca2Q6DIC0 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
Smarca2Q6DIC0 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.17■■■■□ 3.22
Smarca2Q6DIC0 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.17■■■■□ 3.22
Smarca2Q6DIC0 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
Smarca2Q6DIC0 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
Smarca2Q6DIC0 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC35.15■■■■□ 3.22
Smarca2Q6DIC0 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
Smarca2Q6DIC0 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
Smarca2Q6DIC0 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC35.15■■■■□ 3.22
Smarca2Q6DIC0 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
Smarca2Q6DIC0 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
Smarca2Q6DIC0 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.15■■■■□ 3.22
Smarca2Q6DIC0 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.22
Smarca2Q6DIC0 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
Smarca2Q6DIC0 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
Smarca2Q6DIC0 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC35.13■■■■□ 3.21
Smarca2Q6DIC0 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
Smarca2Q6DIC0 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
Smarca2Q6DIC0 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
Smarca2Q6DIC0 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
Smarca2Q6DIC0 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
Smarca2Q6DIC0 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC35.11■■■■□ 3.21
Smarca2Q6DIC0 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
Smarca2Q6DIC0 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
Smarca2Q6DIC0 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
Smarca2Q6DIC0 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC35.1■■■■□ 3.21
Smarca2Q6DIC0 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
Smarca2Q6DIC0 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC35.1■■■■□ 3.21
Smarca2Q6DIC0 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
Smarca2Q6DIC0 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.1■■■■□ 3.21
Smarca2Q6DIC0 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
Smarca2Q6DIC0 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC35.1■■■■□ 3.21
Smarca2Q6DIC0 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
Smarca2Q6DIC0 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
Smarca2Q6DIC0 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC35.09■■■■□ 3.21
Smarca2Q6DIC0 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
Smarca2Q6DIC0 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
Smarca2Q6DIC0 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC35.08■■■■□ 3.21
Smarca2Q6DIC0 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
Smarca2Q6DIC0 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
Smarca2Q6DIC0 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC35.08■■■■□ 3.21
Smarca2Q6DIC0 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
Smarca2Q6DIC0 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
Smarca2Q6DIC0 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
Smarca2Q6DIC0 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC35.07■■■■□ 3.2
Smarca2Q6DIC0 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
Smarca2Q6DIC0 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC35.06■■■■□ 3.2
Smarca2Q6DIC0 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
Smarca2Q6DIC0 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC35.05■■■■□ 3.2
Smarca2Q6DIC0 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
Smarca2Q6DIC0 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
Smarca2Q6DIC0 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
Smarca2Q6DIC0 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC35.05■■■■□ 3.2
Smarca2Q6DIC0 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.04■■■■□ 3.2
Smarca2Q6DIC0 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC35.04■■■■□ 3.2
Smarca2Q6DIC0 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
Smarca2Q6DIC0 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
Smarca2Q6DIC0 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC35.04■■■■□ 3.2
Smarca2Q6DIC0 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC35.04■■■■□ 3.2
Smarca2Q6DIC0 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
Smarca2Q6DIC0 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
Smarca2Q6DIC0 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
Smarca2Q6DIC0 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
Smarca2Q6DIC0 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
Smarca2Q6DIC0 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC35.03■■■■□ 3.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.1 ms