Protein–RNA interactions for Protein: Q6A078

Cep290, Centrosomal protein of 290 kDa, mousemouse

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Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep290Q6A078 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cep290Q6A078 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cep290Q6A078 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cep290Q6A078 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cep290Q6A078 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Cep290Q6A078 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Cep290Q6A078 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Cep290Q6A078 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Cep290Q6A078 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Cep290Q6A078 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cep290Q6A078 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cep290Q6A078 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cep290Q6A078 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cep290Q6A078 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cep290Q6A078 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cep290Q6A078 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cep290Q6A078 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cep290Q6A078 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cep290Q6A078 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cep290Q6A078 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cep290Q6A078 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cep290Q6A078 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cep290Q6A078 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cep290Q6A078 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cep290Q6A078 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cep290Q6A078 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cep290Q6A078 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Cep290Q6A078 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cep290Q6A078 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cep290Q6A078 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cep290Q6A078 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cep290Q6A078 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cep290Q6A078 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cep290Q6A078 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cep290Q6A078 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cep290Q6A078 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cep290Q6A078 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cep290Q6A078 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cep290Q6A078 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cep290Q6A078 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cep290Q6A078 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cep290Q6A078 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cep290Q6A078 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cep290Q6A078 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cep290Q6A078 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cep290Q6A078 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cep290Q6A078 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cep290Q6A078 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cep290Q6A078 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cep290Q6A078 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cep290Q6A078 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cep290Q6A078 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cep290Q6A078 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cep290Q6A078 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cep290Q6A078 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cep290Q6A078 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cep290Q6A078 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Cep290Q6A078 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Cep290Q6A078 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Cep290Q6A078 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Cep290Q6A078 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cep290Q6A078 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cep290Q6A078 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cep290Q6A078 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cep290Q6A078 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cep290Q6A078 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cep290Q6A078 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cep290Q6A078 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cep290Q6A078 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cep290Q6A078 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cep290Q6A078 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cep290Q6A078 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cep290Q6A078 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cep290Q6A078 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cep290Q6A078 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cep290Q6A078 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Cep290Q6A078 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cep290Q6A078 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cep290Q6A078 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cep290Q6A078 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cep290Q6A078 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cep290Q6A078 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Cep290Q6A078 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cep290Q6A078 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cep290Q6A078 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Cep290Q6A078 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cep290Q6A078 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cep290Q6A078 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cep290Q6A078 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cep290Q6A078 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cep290Q6A078 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cep290Q6A078 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cep290Q6A078 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cep290Q6A078 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cep290Q6A078 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cep290Q6A078 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cep290Q6A078 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cep290Q6A078 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cep290Q6A078 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cep290Q6A078 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
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