Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZK0

Prex1, Phosphatidylinositol 3,4,5-trisphosphate-dependent Rac exchanger 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,650 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prex1Q69ZK0 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Prex1Q69ZK0 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Prex1Q69ZK0 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Prex1Q69ZK0 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Prex1Q69ZK0 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Prex1Q69ZK0 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Prex1Q69ZK0 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Prex1Q69ZK0 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Prex1Q69ZK0 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Prex1Q69ZK0 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Prex1Q69ZK0 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Prex1Q69ZK0 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
Prex1Q69ZK0 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Prex1Q69ZK0 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Prex1Q69ZK0 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Prex1Q69ZK0 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Prex1Q69ZK0 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Prex1Q69ZK0 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Prex1Q69ZK0 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Prex1Q69ZK0 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Prex1Q69ZK0 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Prex1Q69ZK0 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Prex1Q69ZK0 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Prex1Q69ZK0 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
Prex1Q69ZK0 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Prex1Q69ZK0 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Prex1Q69ZK0 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Prex1Q69ZK0 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Prex1Q69ZK0 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Prex1Q69ZK0 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Prex1Q69ZK0 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Prex1Q69ZK0 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Prex1Q69ZK0 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Prex1Q69ZK0 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Prex1Q69ZK0 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Prex1Q69ZK0 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Prex1Q69ZK0 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Prex1Q69ZK0 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Prex1Q69ZK0 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Prex1Q69ZK0 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Prex1Q69ZK0 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Prex1Q69ZK0 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Prex1Q69ZK0 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Prex1Q69ZK0 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Prex1Q69ZK0 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Prex1Q69ZK0 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
Prex1Q69ZK0 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
Prex1Q69ZK0 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Prex1Q69ZK0 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Prex1Q69ZK0 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
Prex1Q69ZK0 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Prex1Q69ZK0 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Prex1Q69ZK0 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Prex1Q69ZK0 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Prex1Q69ZK0 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
Prex1Q69ZK0 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Prex1Q69ZK0 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Prex1Q69ZK0 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Prex1Q69ZK0 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Prex1Q69ZK0 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Prex1Q69ZK0 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Prex1Q69ZK0 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Prex1Q69ZK0 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Prex1Q69ZK0 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Prex1Q69ZK0 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Prex1Q69ZK0 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Prex1Q69ZK0 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Prex1Q69ZK0 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Prex1Q69ZK0 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Prex1Q69ZK0 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Prex1Q69ZK0 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Prex1Q69ZK0 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Prex1Q69ZK0 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Prex1Q69ZK0 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Prex1Q69ZK0 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Prex1Q69ZK0 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Prex1Q69ZK0 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Prex1Q69ZK0 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Prex1Q69ZK0 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Prex1Q69ZK0 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Prex1Q69ZK0 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Prex1Q69ZK0 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Prex1Q69ZK0 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Prex1Q69ZK0 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Prex1Q69ZK0 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Prex1Q69ZK0 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Prex1Q69ZK0 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Prex1Q69ZK0 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Prex1Q69ZK0 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Prex1Q69ZK0 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Prex1Q69ZK0 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Prex1Q69ZK0 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Prex1Q69ZK0 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Prex1Q69ZK0 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Prex1Q69ZK0 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Prex1Q69ZK0 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Prex1Q69ZK0 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Prex1Q69ZK0 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Prex1Q69ZK0 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Prex1Q69ZK0 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms