Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZB0

Lrrcc1, Leucine-rich repeat and coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,026 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrcc1Q69ZB0 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lrrcc1Q69ZB0 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lrrcc1Q69ZB0 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lrrcc1Q69ZB0 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lrrcc1Q69ZB0 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lrrcc1Q69ZB0 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lrrcc1Q69ZB0 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lrrcc1Q69ZB0 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lrrcc1Q69ZB0 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lrrcc1Q69ZB0 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lrrcc1Q69ZB0 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lrrcc1Q69ZB0 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lrrcc1Q69ZB0 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lrrcc1Q69ZB0 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lrrcc1Q69ZB0 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lrrcc1Q69ZB0 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lrrcc1Q69ZB0 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lrrcc1Q69ZB0 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lrrcc1Q69ZB0 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lrrcc1Q69ZB0 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lrrcc1Q69ZB0 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Lrrcc1Q69ZB0 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lrrcc1Q69ZB0 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lrrcc1Q69ZB0 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lrrcc1Q69ZB0 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Lrrcc1Q69ZB0 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lrrcc1Q69ZB0 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lrrcc1Q69ZB0 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lrrcc1Q69ZB0 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lrrcc1Q69ZB0 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lrrcc1Q69ZB0 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lrrcc1Q69ZB0 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lrrcc1Q69ZB0 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lrrcc1Q69ZB0 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lrrcc1Q69ZB0 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lrrcc1Q69ZB0 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lrrcc1Q69ZB0 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lrrcc1Q69ZB0 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lrrcc1Q69ZB0 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lrrcc1Q69ZB0 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lrrcc1Q69ZB0 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lrrcc1Q69ZB0 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lrrcc1Q69ZB0 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Lrrcc1Q69ZB0 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Lrrcc1Q69ZB0 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lrrcc1Q69ZB0 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lrrcc1Q69ZB0 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lrrcc1Q69ZB0 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lrrcc1Q69ZB0 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lrrcc1Q69ZB0 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lrrcc1Q69ZB0 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lrrcc1Q69ZB0 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lrrcc1Q69ZB0 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lrrcc1Q69ZB0 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lrrcc1Q69ZB0 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lrrcc1Q69ZB0 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lrrcc1Q69ZB0 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lrrcc1Q69ZB0 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lrrcc1Q69ZB0 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lrrcc1Q69ZB0 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lrrcc1Q69ZB0 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lrrcc1Q69ZB0 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lrrcc1Q69ZB0 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lrrcc1Q69ZB0 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lrrcc1Q69ZB0 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lrrcc1Q69ZB0 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lrrcc1Q69ZB0 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lrrcc1Q69ZB0 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lrrcc1Q69ZB0 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Lrrcc1Q69ZB0 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lrrcc1Q69ZB0 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lrrcc1Q69ZB0 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lrrcc1Q69ZB0 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lrrcc1Q69ZB0 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lrrcc1Q69ZB0 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lrrcc1Q69ZB0 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lrrcc1Q69ZB0 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lrrcc1Q69ZB0 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lrrcc1Q69ZB0 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lrrcc1Q69ZB0 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lrrcc1Q69ZB0 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lrrcc1Q69ZB0 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lrrcc1Q69ZB0 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lrrcc1Q69ZB0 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lrrcc1Q69ZB0 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lrrcc1Q69ZB0 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lrrcc1Q69ZB0 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lrrcc1Q69ZB0 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lrrcc1Q69ZB0 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lrrcc1Q69ZB0 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lrrcc1Q69ZB0 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lrrcc1Q69ZB0 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lrrcc1Q69ZB0 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lrrcc1Q69ZB0 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lrrcc1Q69ZB0 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Lrrcc1Q69ZB0 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lrrcc1Q69ZB0 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lrrcc1Q69ZB0 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lrrcc1Q69ZB0 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lrrcc1Q69ZB0 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.5 ms