Protein–RNA interactions for Protein: Q68FG2

Sptbn2, Spectrin beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 2,388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptbn2Q68FG2 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sptbn2Q68FG2 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sptbn2Q68FG2 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sptbn2Q68FG2 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sptbn2Q68FG2 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sptbn2Q68FG2 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sptbn2Q68FG2 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sptbn2Q68FG2 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sptbn2Q68FG2 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sptbn2Q68FG2 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sptbn2Q68FG2 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Sptbn2Q68FG2 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sptbn2Q68FG2 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sptbn2Q68FG2 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sptbn2Q68FG2 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sptbn2Q68FG2 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sptbn2Q68FG2 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sptbn2Q68FG2 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sptbn2Q68FG2 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Sptbn2Q68FG2 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sptbn2Q68FG2 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sptbn2Q68FG2 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sptbn2Q68FG2 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sptbn2Q68FG2 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sptbn2Q68FG2 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sptbn2Q68FG2 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sptbn2Q68FG2 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sptbn2Q68FG2 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sptbn2Q68FG2 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sptbn2Q68FG2 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sptbn2Q68FG2 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sptbn2Q68FG2 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sptbn2Q68FG2 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sptbn2Q68FG2 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sptbn2Q68FG2 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sptbn2Q68FG2 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sptbn2Q68FG2 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sptbn2Q68FG2 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sptbn2Q68FG2 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sptbn2Q68FG2 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sptbn2Q68FG2 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sptbn2Q68FG2 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sptbn2Q68FG2 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sptbn2Q68FG2 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sptbn2Q68FG2 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sptbn2Q68FG2 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sptbn2Q68FG2 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Sptbn2Q68FG2 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Sptbn2Q68FG2 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Sptbn2Q68FG2 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
Sptbn2Q68FG2 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Sptbn2Q68FG2 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Sptbn2Q68FG2 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Sptbn2Q68FG2 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Sptbn2Q68FG2 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sptbn2Q68FG2 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sptbn2Q68FG2 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sptbn2Q68FG2 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sptbn2Q68FG2 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Sptbn2Q68FG2 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sptbn2Q68FG2 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sptbn2Q68FG2 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sptbn2Q68FG2 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sptbn2Q68FG2 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sptbn2Q68FG2 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sptbn2Q68FG2 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sptbn2Q68FG2 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sptbn2Q68FG2 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sptbn2Q68FG2 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sptbn2Q68FG2 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sptbn2Q68FG2 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sptbn2Q68FG2 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Sptbn2Q68FG2 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sptbn2Q68FG2 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sptbn2Q68FG2 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sptbn2Q68FG2 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sptbn2Q68FG2 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sptbn2Q68FG2 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sptbn2Q68FG2 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sptbn2Q68FG2 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Sptbn2Q68FG2 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Sptbn2Q68FG2 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sptbn2Q68FG2 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sptbn2Q68FG2 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sptbn2Q68FG2 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Sptbn2Q68FG2 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sptbn2Q68FG2 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sptbn2Q68FG2 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sptbn2Q68FG2 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sptbn2Q68FG2 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sptbn2Q68FG2 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sptbn2Q68FG2 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sptbn2Q68FG2 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sptbn2Q68FG2 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sptbn2Q68FG2 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sptbn2Q68FG2 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sptbn2Q68FG2 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Sptbn2Q68FG2 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sptbn2Q68FG2 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sptbn2Q68FG2 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.2 ms