Protein–RNA interactions for Protein: Q64253

Ly6e, Lymphocyte antigen 6E, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ly6eQ64253 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ly6eQ64253 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ly6eQ64253 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ly6eQ64253 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ly6eQ64253 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ly6eQ64253 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ly6eQ64253 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ly6eQ64253 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ly6eQ64253 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ly6eQ64253 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ly6eQ64253 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ly6eQ64253 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ly6eQ64253 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ly6eQ64253 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ly6eQ64253 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ly6eQ64253 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ly6eQ64253 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ly6eQ64253 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ly6eQ64253 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ly6eQ64253 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ly6eQ64253 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Ly6eQ64253 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ly6eQ64253 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ly6eQ64253 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ly6eQ64253 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ly6eQ64253 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ly6eQ64253 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ly6eQ64253 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ly6eQ64253 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ly6eQ64253 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ly6eQ64253 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ly6eQ64253 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ly6eQ64253 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ly6eQ64253 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ly6eQ64253 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ly6eQ64253 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ly6eQ64253 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ly6eQ64253 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ly6eQ64253 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ly6eQ64253 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ly6eQ64253 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Ly6eQ64253 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ly6eQ64253 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ly6eQ64253 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ly6eQ64253 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ly6eQ64253 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ly6eQ64253 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ly6eQ64253 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ly6eQ64253 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ly6eQ64253 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ly6eQ64253 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ly6eQ64253 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ly6eQ64253 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ly6eQ64253 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ly6eQ64253 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Ly6eQ64253 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ly6eQ64253 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ly6eQ64253 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ly6eQ64253 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ly6eQ64253 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ly6eQ64253 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ly6eQ64253 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ly6eQ64253 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ly6eQ64253 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ly6eQ64253 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ly6eQ64253 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ly6eQ64253 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ly6eQ64253 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ly6eQ64253 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ly6eQ64253 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ly6eQ64253 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ly6eQ64253 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ly6eQ64253 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ly6eQ64253 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Ly6eQ64253 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ly6eQ64253 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ly6eQ64253 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ly6eQ64253 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ly6eQ64253 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ly6eQ64253 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ly6eQ64253 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ly6eQ64253 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ly6eQ64253 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ly6eQ64253 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ly6eQ64253 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ly6eQ64253 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ly6eQ64253 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ly6eQ64253 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ly6eQ64253 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ly6eQ64253 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ly6eQ64253 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ly6eQ64253 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ly6eQ64253 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ly6eQ64253 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ly6eQ64253 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Ly6eQ64253 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ly6eQ64253 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ly6eQ64253 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ly6eQ64253 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ly6eQ64253 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms