Protein–RNA interactions for Protein: Q64124

Scx, Basic helix-loop-helix transcription factor scleraxis, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScxQ64124 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
ScxQ64124 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
ScxQ64124 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
ScxQ64124 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
ScxQ64124 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
ScxQ64124 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
ScxQ64124 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
ScxQ64124 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
ScxQ64124 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
ScxQ64124 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
ScxQ64124 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
ScxQ64124 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
ScxQ64124 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
ScxQ64124 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
ScxQ64124 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
ScxQ64124 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
ScxQ64124 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
ScxQ64124 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
ScxQ64124 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
ScxQ64124 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
ScxQ64124 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ScxQ64124 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ScxQ64124 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ScxQ64124 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ScxQ64124 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ScxQ64124 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ScxQ64124 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ScxQ64124 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
ScxQ64124 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ScxQ64124 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ScxQ64124 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ScxQ64124 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ScxQ64124 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
ScxQ64124 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ScxQ64124 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ScxQ64124 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ScxQ64124 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ScxQ64124 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ScxQ64124 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ScxQ64124 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ScxQ64124 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ScxQ64124 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ScxQ64124 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ScxQ64124 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ScxQ64124 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ScxQ64124 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ScxQ64124 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ScxQ64124 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
ScxQ64124 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ScxQ64124 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ScxQ64124 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ScxQ64124 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
ScxQ64124 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
ScxQ64124 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ScxQ64124 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ScxQ64124 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ScxQ64124 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
ScxQ64124 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ScxQ64124 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ScxQ64124 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ScxQ64124 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ScxQ64124 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ScxQ64124 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ScxQ64124 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
ScxQ64124 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
ScxQ64124 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
ScxQ64124 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
ScxQ64124 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
ScxQ64124 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ScxQ64124 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
ScxQ64124 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ScxQ64124 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ScxQ64124 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ScxQ64124 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
ScxQ64124 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ScxQ64124 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
ScxQ64124 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
ScxQ64124 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
ScxQ64124 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ScxQ64124 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
ScxQ64124 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
ScxQ64124 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ScxQ64124 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ScxQ64124 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
ScxQ64124 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
ScxQ64124 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
ScxQ64124 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ScxQ64124 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ScxQ64124 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
ScxQ64124 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
ScxQ64124 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
ScxQ64124 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ScxQ64124 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ScxQ64124 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ScxQ64124 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ScxQ64124 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ScxQ64124 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ScxQ64124 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ScxQ64124 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ScxQ64124 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms