Protein–RNA interactions for Protein: Q640Q5

Pan3, PAN2-PAN3 deadenylation complex subunit Pan3, mousemouse

Predictions only

Length 837 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pan3Q640Q5 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pan3Q640Q5 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pan3Q640Q5 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pan3Q640Q5 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pan3Q640Q5 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Pan3Q640Q5 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pan3Q640Q5 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pan3Q640Q5 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pan3Q640Q5 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pan3Q640Q5 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pan3Q640Q5 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pan3Q640Q5 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pan3Q640Q5 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pan3Q640Q5 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pan3Q640Q5 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pan3Q640Q5 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pan3Q640Q5 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pan3Q640Q5 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pan3Q640Q5 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pan3Q640Q5 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pan3Q640Q5 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pan3Q640Q5 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pan3Q640Q5 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pan3Q640Q5 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pan3Q640Q5 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pan3Q640Q5 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Pan3Q640Q5 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pan3Q640Q5 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pan3Q640Q5 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pan3Q640Q5 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pan3Q640Q5 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pan3Q640Q5 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pan3Q640Q5 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pan3Q640Q5 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pan3Q640Q5 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pan3Q640Q5 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Pan3Q640Q5 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pan3Q640Q5 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pan3Q640Q5 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pan3Q640Q5 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pan3Q640Q5 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pan3Q640Q5 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pan3Q640Q5 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pan3Q640Q5 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pan3Q640Q5 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pan3Q640Q5 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pan3Q640Q5 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pan3Q640Q5 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pan3Q640Q5 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pan3Q640Q5 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pan3Q640Q5 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pan3Q640Q5 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pan3Q640Q5 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pan3Q640Q5 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pan3Q640Q5 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pan3Q640Q5 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pan3Q640Q5 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pan3Q640Q5 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pan3Q640Q5 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pan3Q640Q5 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pan3Q640Q5 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pan3Q640Q5 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pan3Q640Q5 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pan3Q640Q5 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pan3Q640Q5 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Pan3Q640Q5 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Pan3Q640Q5 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Pan3Q640Q5 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pan3Q640Q5 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pan3Q640Q5 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pan3Q640Q5 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pan3Q640Q5 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pan3Q640Q5 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pan3Q640Q5 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pan3Q640Q5 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pan3Q640Q5 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pan3Q640Q5 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pan3Q640Q5 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pan3Q640Q5 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pan3Q640Q5 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Pan3Q640Q5 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pan3Q640Q5 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pan3Q640Q5 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pan3Q640Q5 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pan3Q640Q5 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pan3Q640Q5 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pan3Q640Q5 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pan3Q640Q5 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pan3Q640Q5 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pan3Q640Q5 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pan3Q640Q5 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pan3Q640Q5 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pan3Q640Q5 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pan3Q640Q5 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pan3Q640Q5 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Pan3Q640Q5 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pan3Q640Q5 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pan3Q640Q5 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pan3Q640Q5 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pan3Q640Q5 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 118.5 ms