Protein–RNA interactions for Protein: Q63ZW7

Patj, InaD-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PatjQ63ZW7 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PatjQ63ZW7 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PatjQ63ZW7 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PatjQ63ZW7 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PatjQ63ZW7 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PatjQ63ZW7 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PatjQ63ZW7 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PatjQ63ZW7 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PatjQ63ZW7 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PatjQ63ZW7 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PatjQ63ZW7 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PatjQ63ZW7 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PatjQ63ZW7 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PatjQ63ZW7 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PatjQ63ZW7 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PatjQ63ZW7 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PatjQ63ZW7 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PatjQ63ZW7 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PatjQ63ZW7 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PatjQ63ZW7 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PatjQ63ZW7 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PatjQ63ZW7 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PatjQ63ZW7 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PatjQ63ZW7 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PatjQ63ZW7 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PatjQ63ZW7 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PatjQ63ZW7 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PatjQ63ZW7 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PatjQ63ZW7 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PatjQ63ZW7 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PatjQ63ZW7 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PatjQ63ZW7 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PatjQ63ZW7 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PatjQ63ZW7 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PatjQ63ZW7 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PatjQ63ZW7 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PatjQ63ZW7 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PatjQ63ZW7 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PatjQ63ZW7 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PatjQ63ZW7 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PatjQ63ZW7 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PatjQ63ZW7 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
PatjQ63ZW7 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PatjQ63ZW7 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PatjQ63ZW7 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PatjQ63ZW7 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PatjQ63ZW7 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PatjQ63ZW7 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PatjQ63ZW7 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PatjQ63ZW7 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PatjQ63ZW7 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PatjQ63ZW7 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PatjQ63ZW7 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PatjQ63ZW7 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PatjQ63ZW7 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PatjQ63ZW7 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PatjQ63ZW7 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PatjQ63ZW7 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PatjQ63ZW7 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PatjQ63ZW7 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PatjQ63ZW7 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PatjQ63ZW7 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PatjQ63ZW7 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PatjQ63ZW7 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PatjQ63ZW7 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PatjQ63ZW7 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PatjQ63ZW7 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PatjQ63ZW7 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PatjQ63ZW7 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PatjQ63ZW7 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PatjQ63ZW7 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PatjQ63ZW7 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PatjQ63ZW7 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PatjQ63ZW7 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PatjQ63ZW7 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PatjQ63ZW7 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PatjQ63ZW7 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PatjQ63ZW7 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PatjQ63ZW7 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PatjQ63ZW7 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PatjQ63ZW7 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PatjQ63ZW7 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PatjQ63ZW7 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PatjQ63ZW7 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PatjQ63ZW7 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PatjQ63ZW7 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PatjQ63ZW7 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PatjQ63ZW7 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PatjQ63ZW7 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PatjQ63ZW7 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PatjQ63ZW7 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PatjQ63ZW7 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PatjQ63ZW7 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PatjQ63ZW7 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PatjQ63ZW7 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PatjQ63ZW7 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PatjQ63ZW7 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PatjQ63ZW7 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PatjQ63ZW7 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PatjQ63ZW7 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms