Protein–RNA interactions for Protein: Q62465

Vat1, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vat1Q62465 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Vat1Q62465 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Vat1Q62465 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Vat1Q62465 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Vat1Q62465 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Vat1Q62465 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Vat1Q62465 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Vat1Q62465 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Vat1Q62465 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Vat1Q62465 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Vat1Q62465 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Vat1Q62465 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Vat1Q62465 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Vat1Q62465 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Vat1Q62465 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Vat1Q62465 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Vat1Q62465 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Vat1Q62465 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Vat1Q62465 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Vat1Q62465 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Vat1Q62465 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Vat1Q62465 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Vat1Q62465 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Vat1Q62465 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Vat1Q62465 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Vat1Q62465 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Vat1Q62465 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Vat1Q62465 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Vat1Q62465 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Vat1Q62465 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Vat1Q62465 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Vat1Q62465 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Vat1Q62465 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Vat1Q62465 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Vat1Q62465 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Vat1Q62465 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Vat1Q62465 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Vat1Q62465 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Vat1Q62465 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Vat1Q62465 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Vat1Q62465 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Vat1Q62465 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Vat1Q62465 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Vat1Q62465 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Vat1Q62465 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Vat1Q62465 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Vat1Q62465 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Vat1Q62465 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Vat1Q62465 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Vat1Q62465 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Vat1Q62465 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Vat1Q62465 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Vat1Q62465 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Vat1Q62465 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Vat1Q62465 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Vat1Q62465 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Vat1Q62465 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Vat1Q62465 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Vat1Q62465 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Vat1Q62465 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Vat1Q62465 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Vat1Q62465 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Vat1Q62465 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Vat1Q62465 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Vat1Q62465 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Vat1Q62465 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Vat1Q62465 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Vat1Q62465 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Vat1Q62465 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Vat1Q62465 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Vat1Q62465 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Vat1Q62465 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Vat1Q62465 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Vat1Q62465 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Vat1Q62465 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Vat1Q62465 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Vat1Q62465 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Vat1Q62465 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Vat1Q62465 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Vat1Q62465 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Vat1Q62465 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Vat1Q62465 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Vat1Q62465 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Vat1Q62465 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Vat1Q62465 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Vat1Q62465 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Vat1Q62465 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Vat1Q62465 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Vat1Q62465 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Vat1Q62465 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Vat1Q62465 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Vat1Q62465 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Vat1Q62465 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Vat1Q62465 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Vat1Q62465 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Vat1Q62465 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Vat1Q62465 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Vat1Q62465 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Vat1Q62465 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Vat1Q62465 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms