Protein–RNA interactions for Protein: Q62413

Epha6, Ephrin type-A receptor 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,035 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epha6Q62413 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Epha6Q62413 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Epha6Q62413 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Epha6Q62413 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Epha6Q62413 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Epha6Q62413 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Epha6Q62413 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Epha6Q62413 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Epha6Q62413 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Epha6Q62413 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Epha6Q62413 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Epha6Q62413 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Epha6Q62413 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Epha6Q62413 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Epha6Q62413 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Epha6Q62413 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Epha6Q62413 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Epha6Q62413 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Epha6Q62413 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Epha6Q62413 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Epha6Q62413 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Epha6Q62413 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Epha6Q62413 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Epha6Q62413 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Epha6Q62413 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Epha6Q62413 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Epha6Q62413 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Epha6Q62413 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Epha6Q62413 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Epha6Q62413 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Epha6Q62413 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Epha6Q62413 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Epha6Q62413 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Epha6Q62413 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Epha6Q62413 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Epha6Q62413 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Epha6Q62413 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Epha6Q62413 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Epha6Q62413 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Epha6Q62413 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Epha6Q62413 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Epha6Q62413 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Epha6Q62413 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Epha6Q62413 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Epha6Q62413 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Epha6Q62413 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Epha6Q62413 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Epha6Q62413 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Epha6Q62413 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Epha6Q62413 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Epha6Q62413 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Epha6Q62413 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Epha6Q62413 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Epha6Q62413 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Epha6Q62413 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Epha6Q62413 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Epha6Q62413 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Epha6Q62413 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Epha6Q62413 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Epha6Q62413 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Epha6Q62413 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Epha6Q62413 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Epha6Q62413 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Epha6Q62413 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Epha6Q62413 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Epha6Q62413 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Epha6Q62413 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Epha6Q62413 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Epha6Q62413 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Epha6Q62413 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Epha6Q62413 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Epha6Q62413 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Epha6Q62413 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Epha6Q62413 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Epha6Q62413 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Epha6Q62413 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Epha6Q62413 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Epha6Q62413 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Epha6Q62413 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Epha6Q62413 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Epha6Q62413 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Epha6Q62413 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Epha6Q62413 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Epha6Q62413 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Epha6Q62413 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Epha6Q62413 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Epha6Q62413 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Epha6Q62413 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Epha6Q62413 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Epha6Q62413 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Epha6Q62413 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Epha6Q62413 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Epha6Q62413 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Epha6Q62413 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Epha6Q62413 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Epha6Q62413 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Epha6Q62413 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Epha6Q62413 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Epha6Q62413 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Epha6Q62413 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms