Protein–RNA interactions for Protein: Q62395

Tff3, Trefoil factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tff3Q62395 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tff3Q62395 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tff3Q62395 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tff3Q62395 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tff3Q62395 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tff3Q62395 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tff3Q62395 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Tff3Q62395 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tff3Q62395 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tff3Q62395 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tff3Q62395 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tff3Q62395 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tff3Q62395 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tff3Q62395 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tff3Q62395 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tff3Q62395 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tff3Q62395 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Tff3Q62395 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tff3Q62395 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tff3Q62395 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tff3Q62395 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tff3Q62395 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tff3Q62395 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tff3Q62395 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tff3Q62395 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tff3Q62395 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tff3Q62395 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tff3Q62395 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tff3Q62395 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tff3Q62395 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tff3Q62395 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tff3Q62395 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tff3Q62395 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tff3Q62395 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tff3Q62395 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tff3Q62395 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tff3Q62395 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tff3Q62395 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tff3Q62395 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tff3Q62395 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tff3Q62395 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tff3Q62395 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tff3Q62395 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tff3Q62395 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tff3Q62395 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Tff3Q62395 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Tff3Q62395 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tff3Q62395 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tff3Q62395 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tff3Q62395 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tff3Q62395 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Tff3Q62395 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tff3Q62395 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tff3Q62395 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tff3Q62395 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tff3Q62395 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tff3Q62395 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tff3Q62395 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Tff3Q62395 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tff3Q62395 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Tff3Q62395 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Tff3Q62395 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tff3Q62395 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tff3Q62395 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tff3Q62395 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tff3Q62395 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tff3Q62395 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tff3Q62395 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tff3Q62395 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tff3Q62395 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tff3Q62395 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Tff3Q62395 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tff3Q62395 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Tff3Q62395 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tff3Q62395 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tff3Q62395 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tff3Q62395 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Tff3Q62395 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tff3Q62395 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tff3Q62395 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tff3Q62395 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tff3Q62395 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tff3Q62395 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tff3Q62395 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Tff3Q62395 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tff3Q62395 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tff3Q62395 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tff3Q62395 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tff3Q62395 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tff3Q62395 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tff3Q62395 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tff3Q62395 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tff3Q62395 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tff3Q62395 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tff3Q62395 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tff3Q62395 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Tff3Q62395 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tff3Q62395 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tff3Q62395 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tff3Q62395 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms