Protein–RNA interactions for Protein: Q62158

Trim27, Zinc finger protein RFP, mousemouse

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim27Q62158 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Trim27Q62158 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Trim27Q62158 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Trim27Q62158 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Trim27Q62158 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Trim27Q62158 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Trim27Q62158 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trim27Q62158 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trim27Q62158 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trim27Q62158 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trim27Q62158 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trim27Q62158 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trim27Q62158 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trim27Q62158 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trim27Q62158 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trim27Q62158 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Trim27Q62158 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Trim27Q62158 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Trim27Q62158 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Trim27Q62158 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Trim27Q62158 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Trim27Q62158 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Trim27Q62158 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Trim27Q62158 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Trim27Q62158 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Trim27Q62158 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Trim27Q62158 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Trim27Q62158 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Trim27Q62158 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Trim27Q62158 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Trim27Q62158 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Trim27Q62158 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Trim27Q62158 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Trim27Q62158 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Trim27Q62158 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Trim27Q62158 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Trim27Q62158 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Trim27Q62158 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Trim27Q62158 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Trim27Q62158 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Trim27Q62158 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Trim27Q62158 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Trim27Q62158 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trim27Q62158 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Trim27Q62158 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trim27Q62158 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trim27Q62158 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trim27Q62158 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trim27Q62158 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Trim27Q62158 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trim27Q62158 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trim27Q62158 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Trim27Q62158 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Trim27Q62158 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trim27Q62158 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trim27Q62158 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trim27Q62158 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trim27Q62158 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trim27Q62158 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trim27Q62158 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trim27Q62158 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trim27Q62158 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trim27Q62158 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trim27Q62158 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trim27Q62158 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trim27Q62158 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Trim27Q62158 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Trim27Q62158 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Trim27Q62158 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Trim27Q62158 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Trim27Q62158 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Trim27Q62158 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Trim27Q62158 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Trim27Q62158 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trim27Q62158 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trim27Q62158 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trim27Q62158 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trim27Q62158 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trim27Q62158 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Trim27Q62158 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trim27Q62158 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trim27Q62158 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Trim27Q62158 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Trim27Q62158 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Trim27Q62158 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Trim27Q62158 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Trim27Q62158 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trim27Q62158 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trim27Q62158 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trim27Q62158 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trim27Q62158 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Trim27Q62158 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Trim27Q62158 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Trim27Q62158 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Trim27Q62158 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Trim27Q62158 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Trim27Q62158 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Trim27Q62158 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Trim27Q62158 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Trim27Q62158 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms