Protein–RNA interactions for Protein: Q62132

Ptprr, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase R, mousemouse

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprrQ62132 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
PtprrQ62132 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PtprrQ62132 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PtprrQ62132 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PtprrQ62132 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
PtprrQ62132 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PtprrQ62132 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PtprrQ62132 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PtprrQ62132 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
PtprrQ62132 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PtprrQ62132 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
PtprrQ62132 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PtprrQ62132 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PtprrQ62132 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PtprrQ62132 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PtprrQ62132 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
PtprrQ62132 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PtprrQ62132 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PtprrQ62132 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PtprrQ62132 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PtprrQ62132 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PtprrQ62132 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PtprrQ62132 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
PtprrQ62132 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PtprrQ62132 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PtprrQ62132 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PtprrQ62132 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PtprrQ62132 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PtprrQ62132 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PtprrQ62132 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PtprrQ62132 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PtprrQ62132 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PtprrQ62132 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PtprrQ62132 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PtprrQ62132 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PtprrQ62132 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PtprrQ62132 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PtprrQ62132 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PtprrQ62132 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PtprrQ62132 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PtprrQ62132 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
PtprrQ62132 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PtprrQ62132 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PtprrQ62132 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PtprrQ62132 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PtprrQ62132 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PtprrQ62132 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PtprrQ62132 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
PtprrQ62132 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PtprrQ62132 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PtprrQ62132 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PtprrQ62132 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PtprrQ62132 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PtprrQ62132 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PtprrQ62132 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PtprrQ62132 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PtprrQ62132 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PtprrQ62132 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PtprrQ62132 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PtprrQ62132 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PtprrQ62132 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PtprrQ62132 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PtprrQ62132 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PtprrQ62132 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PtprrQ62132 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PtprrQ62132 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PtprrQ62132 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PtprrQ62132 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PtprrQ62132 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PtprrQ62132 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PtprrQ62132 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PtprrQ62132 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PtprrQ62132 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PtprrQ62132 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PtprrQ62132 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PtprrQ62132 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
PtprrQ62132 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
PtprrQ62132 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PtprrQ62132 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PtprrQ62132 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PtprrQ62132 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PtprrQ62132 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PtprrQ62132 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PtprrQ62132 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PtprrQ62132 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
PtprrQ62132 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PtprrQ62132 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PtprrQ62132 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PtprrQ62132 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PtprrQ62132 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PtprrQ62132 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PtprrQ62132 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PtprrQ62132 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PtprrQ62132 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PtprrQ62132 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PtprrQ62132 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PtprrQ62132 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PtprrQ62132 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PtprrQ62132 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PtprrQ62132 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.4 ms