Protein–RNA interactions for Protein: Q61999

Odf1, Outer dense fiber protein 1, mousemouse

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Length 247 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf1Q61999 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Odf1Q61999 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Odf1Q61999 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Odf1Q61999 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Odf1Q61999 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Odf1Q61999 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Odf1Q61999 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
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Odf1Q61999 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Odf1Q61999 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Odf1Q61999 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Odf1Q61999 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Odf1Q61999 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Odf1Q61999 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Odf1Q61999 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Odf1Q61999 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Odf1Q61999 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Odf1Q61999 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Odf1Q61999 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Odf1Q61999 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Odf1Q61999 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Odf1Q61999 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Odf1Q61999 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Odf1Q61999 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Odf1Q61999 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Odf1Q61999 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Odf1Q61999 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Odf1Q61999 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Odf1Q61999 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Odf1Q61999 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Odf1Q61999 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Odf1Q61999 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Odf1Q61999 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Odf1Q61999 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Odf1Q61999 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Odf1Q61999 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Odf1Q61999 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Odf1Q61999 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Odf1Q61999 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Odf1Q61999 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Odf1Q61999 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Odf1Q61999 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Odf1Q61999 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Odf1Q61999 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Odf1Q61999 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Odf1Q61999 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Odf1Q61999 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Odf1Q61999 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Odf1Q61999 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Odf1Q61999 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Odf1Q61999 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Odf1Q61999 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Odf1Q61999 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Odf1Q61999 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Odf1Q61999 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Odf1Q61999 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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