Protein–RNA interactions for Protein: Q61687

Atrx, Transcriptional regulator ATRX, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AtrxQ61687 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
AtrxQ61687 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
AtrxQ61687 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
AtrxQ61687 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
AtrxQ61687 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
AtrxQ61687 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
AtrxQ61687 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
AtrxQ61687 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
AtrxQ61687 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
AtrxQ61687 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
AtrxQ61687 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
AtrxQ61687 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
AtrxQ61687 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
AtrxQ61687 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
AtrxQ61687 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
AtrxQ61687 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
AtrxQ61687 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
AtrxQ61687 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
AtrxQ61687 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
AtrxQ61687 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
AtrxQ61687 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
AtrxQ61687 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
AtrxQ61687 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
AtrxQ61687 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
AtrxQ61687 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
AtrxQ61687 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
AtrxQ61687 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
AtrxQ61687 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
AtrxQ61687 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
AtrxQ61687 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
AtrxQ61687 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
AtrxQ61687 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
AtrxQ61687 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
AtrxQ61687 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
AtrxQ61687 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
AtrxQ61687 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
AtrxQ61687 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
AtrxQ61687 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
AtrxQ61687 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
AtrxQ61687 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
AtrxQ61687 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
AtrxQ61687 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
AtrxQ61687 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
AtrxQ61687 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
AtrxQ61687 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
AtrxQ61687 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
AtrxQ61687 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
AtrxQ61687 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
AtrxQ61687 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
AtrxQ61687 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
AtrxQ61687 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
AtrxQ61687 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
AtrxQ61687 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
AtrxQ61687 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
AtrxQ61687 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
AtrxQ61687 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
AtrxQ61687 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
AtrxQ61687 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
AtrxQ61687 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
AtrxQ61687 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
AtrxQ61687 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
AtrxQ61687 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
AtrxQ61687 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
AtrxQ61687 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
AtrxQ61687 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
AtrxQ61687 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
AtrxQ61687 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
AtrxQ61687 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
AtrxQ61687 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
AtrxQ61687 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
AtrxQ61687 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
AtrxQ61687 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
AtrxQ61687 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
AtrxQ61687 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
AtrxQ61687 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
AtrxQ61687 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
AtrxQ61687 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
AtrxQ61687 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
AtrxQ61687 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
AtrxQ61687 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
AtrxQ61687 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
AtrxQ61687 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
AtrxQ61687 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
AtrxQ61687 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
AtrxQ61687 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
AtrxQ61687 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
AtrxQ61687 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
AtrxQ61687 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.43
AtrxQ61687 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
AtrxQ61687 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
AtrxQ61687 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
AtrxQ61687 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
AtrxQ61687 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
AtrxQ61687 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
AtrxQ61687 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
AtrxQ61687 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
AtrxQ61687 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
AtrxQ61687 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
AtrxQ61687 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
AtrxQ61687 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms