Protein–RNA interactions for Protein: Q61602

Gli3, Transcriptional activator GLI3, mousemouse

Predictions only

Length 1,583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gli3Q61602 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Gli3Q61602 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Gli3Q61602 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Gli3Q61602 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Gli3Q61602 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Gli3Q61602 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Gli3Q61602 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Gli3Q61602 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Gli3Q61602 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Gli3Q61602 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
Gli3Q61602 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
Gli3Q61602 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Gli3Q61602 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Gli3Q61602 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Gli3Q61602 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Gli3Q61602 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Gli3Q61602 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Gli3Q61602 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Gli3Q61602 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Gli3Q61602 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
Gli3Q61602 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC27.26■■□□□ 1.96
Gli3Q61602 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
Gli3Q61602 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC27.26■■□□□ 1.96
Gli3Q61602 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC27.26■■□□□ 1.96
Gli3Q61602 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
Gli3Q61602 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
Gli3Q61602 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Gli3Q61602 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Gli3Q61602 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
Gli3Q61602 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Gli3Q61602 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Gli3Q61602 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Gli3Q61602 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Gli3Q61602 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Gli3Q61602 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Gli3Q61602 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Gli3Q61602 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Gli3Q61602 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Gli3Q61602 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Gli3Q61602 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Gli3Q61602 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Gli3Q61602 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Gli3Q61602 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Gli3Q61602 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Gli3Q61602 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Gli3Q61602 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Gli3Q61602 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Gli3Q61602 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Gli3Q61602 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Gli3Q61602 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Gli3Q61602 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Gli3Q61602 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Gli3Q61602 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
Gli3Q61602 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Gli3Q61602 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Gli3Q61602 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
Gli3Q61602 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Gli3Q61602 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Gli3Q61602 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Gli3Q61602 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Gli3Q61602 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Gli3Q61602 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Gli3Q61602 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Gli3Q61602 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Gli3Q61602 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Gli3Q61602 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Gli3Q61602 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Gli3Q61602 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Gli3Q61602 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Gli3Q61602 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Gli3Q61602 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Gli3Q61602 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Gli3Q61602 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Gli3Q61602 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Gli3Q61602 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Gli3Q61602 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Gli3Q61602 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Gli3Q61602 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Gli3Q61602 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Gli3Q61602 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Gli3Q61602 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Gli3Q61602 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Gli3Q61602 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Gli3Q61602 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Gli3Q61602 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Gli3Q61602 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Gli3Q61602 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Gli3Q61602 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Gli3Q61602 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Gli3Q61602 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Gli3Q61602 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Gli3Q61602 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Gli3Q61602 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Gli3Q61602 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Gli3Q61602 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Gli3Q61602 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Gli3Q61602 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Gli3Q61602 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Gli3Q61602 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Gli3Q61602 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms