Protein–RNA interactions for Protein: Q61508

Ecm1, Extracellular matrix protein 1, mousemouse

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ecm1Q61508 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ecm1Q61508 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ecm1Q61508 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ecm1Q61508 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Ecm1Q61508 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Ecm1Q61508 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ecm1Q61508 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ecm1Q61508 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Ecm1Q61508 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ecm1Q61508 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ecm1Q61508 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ecm1Q61508 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Ecm1Q61508 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ecm1Q61508 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ecm1Q61508 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ecm1Q61508 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ecm1Q61508 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ecm1Q61508 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ecm1Q61508 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ecm1Q61508 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ecm1Q61508 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ecm1Q61508 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Ecm1Q61508 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ecm1Q61508 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ecm1Q61508 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ecm1Q61508 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ecm1Q61508 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ecm1Q61508 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ecm1Q61508 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ecm1Q61508 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ecm1Q61508 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ecm1Q61508 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ecm1Q61508 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ecm1Q61508 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ecm1Q61508 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ecm1Q61508 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ecm1Q61508 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ecm1Q61508 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ecm1Q61508 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Ecm1Q61508 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ecm1Q61508 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ecm1Q61508 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ecm1Q61508 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ecm1Q61508 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ecm1Q61508 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ecm1Q61508 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ecm1Q61508 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ecm1Q61508 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ecm1Q61508 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Ecm1Q61508 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ecm1Q61508 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ecm1Q61508 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ecm1Q61508 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Ecm1Q61508 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ecm1Q61508 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ecm1Q61508 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ecm1Q61508 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ecm1Q61508 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ecm1Q61508 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Ecm1Q61508 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Ecm1Q61508 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Ecm1Q61508 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ecm1Q61508 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Ecm1Q61508 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Ecm1Q61508 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Ecm1Q61508 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ecm1Q61508 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ecm1Q61508 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ecm1Q61508 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ecm1Q61508 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ecm1Q61508 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ecm1Q61508 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ecm1Q61508 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ecm1Q61508 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ecm1Q61508 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Ecm1Q61508 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ecm1Q61508 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Ecm1Q61508 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ecm1Q61508 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Ecm1Q61508 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ecm1Q61508 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ecm1Q61508 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ecm1Q61508 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ecm1Q61508 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ecm1Q61508 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ecm1Q61508 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ecm1Q61508 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ecm1Q61508 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ecm1Q61508 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ecm1Q61508 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Ecm1Q61508 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ecm1Q61508 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ecm1Q61508 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ecm1Q61508 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ecm1Q61508 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Ecm1Q61508 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ecm1Q61508 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ecm1Q61508 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Ecm1Q61508 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ecm1Q61508 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms