Protein–RNA interactions for Protein: Q61313

Tfap2b, Transcription factor AP-2-beta, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfap2bQ61313 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tfap2bQ61313 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Tfap2bQ61313 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tfap2bQ61313 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tfap2bQ61313 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tfap2bQ61313 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tfap2bQ61313 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tfap2bQ61313 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tfap2bQ61313 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tfap2bQ61313 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tfap2bQ61313 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tfap2bQ61313 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tfap2bQ61313 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tfap2bQ61313 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tfap2bQ61313 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tfap2bQ61313 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Tfap2bQ61313 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tfap2bQ61313 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tfap2bQ61313 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tfap2bQ61313 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tfap2bQ61313 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tfap2bQ61313 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tfap2bQ61313 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tfap2bQ61313 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Tfap2bQ61313 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Tfap2bQ61313 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tfap2bQ61313 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tfap2bQ61313 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tfap2bQ61313 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tfap2bQ61313 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tfap2bQ61313 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tfap2bQ61313 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tfap2bQ61313 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tfap2bQ61313 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tfap2bQ61313 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tfap2bQ61313 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tfap2bQ61313 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tfap2bQ61313 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tfap2bQ61313 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tfap2bQ61313 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tfap2bQ61313 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Tfap2bQ61313 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tfap2bQ61313 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tfap2bQ61313 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tfap2bQ61313 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tfap2bQ61313 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tfap2bQ61313 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tfap2bQ61313 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tfap2bQ61313 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tfap2bQ61313 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tfap2bQ61313 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tfap2bQ61313 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tfap2bQ61313 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tfap2bQ61313 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tfap2bQ61313 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tfap2bQ61313 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tfap2bQ61313 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tfap2bQ61313 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tfap2bQ61313 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tfap2bQ61313 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tfap2bQ61313 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tfap2bQ61313 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tfap2bQ61313 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tfap2bQ61313 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tfap2bQ61313 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tfap2bQ61313 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tfap2bQ61313 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Tfap2bQ61313 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tfap2bQ61313 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tfap2bQ61313 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tfap2bQ61313 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tfap2bQ61313 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Tfap2bQ61313 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tfap2bQ61313 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Tfap2bQ61313 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tfap2bQ61313 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tfap2bQ61313 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tfap2bQ61313 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tfap2bQ61313 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tfap2bQ61313 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tfap2bQ61313 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tfap2bQ61313 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tfap2bQ61313 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tfap2bQ61313 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Tfap2bQ61313 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.87
Tfap2bQ61313 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tfap2bQ61313 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tfap2bQ61313 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tfap2bQ61313 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tfap2bQ61313 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tfap2bQ61313 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tfap2bQ61313 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tfap2bQ61313 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Tfap2bQ61313 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tfap2bQ61313 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tfap2bQ61313 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tfap2bQ61313 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tfap2bQ61313 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tfap2bQ61313 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tfap2bQ61313 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms