Protein–RNA interactions for Protein: Q61043

Nin, Ninein, mousemouse

Predictions only

Length 2,035 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NinQ61043 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NinQ61043 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NinQ61043 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NinQ61043 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NinQ61043 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NinQ61043 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NinQ61043 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NinQ61043 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NinQ61043 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NinQ61043 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NinQ61043 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NinQ61043 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NinQ61043 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
NinQ61043 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NinQ61043 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NinQ61043 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NinQ61043 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NinQ61043 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NinQ61043 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NinQ61043 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NinQ61043 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NinQ61043 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NinQ61043 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NinQ61043 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NinQ61043 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NinQ61043 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NinQ61043 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NinQ61043 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NinQ61043 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NinQ61043 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NinQ61043 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NinQ61043 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NinQ61043 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NinQ61043 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NinQ61043 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NinQ61043 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NinQ61043 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NinQ61043 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
NinQ61043 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NinQ61043 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NinQ61043 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
NinQ61043 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
NinQ61043 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
NinQ61043 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
NinQ61043 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
NinQ61043 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.28
NinQ61043 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
NinQ61043 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NinQ61043 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NinQ61043 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NinQ61043 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NinQ61043 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NinQ61043 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NinQ61043 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NinQ61043 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NinQ61043 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NinQ61043 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NinQ61043 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NinQ61043 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NinQ61043 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NinQ61043 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NinQ61043 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NinQ61043 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NinQ61043 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NinQ61043 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NinQ61043 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NinQ61043 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
NinQ61043 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NinQ61043 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NinQ61043 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NinQ61043 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NinQ61043 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
NinQ61043 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
NinQ61043 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
NinQ61043 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NinQ61043 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NinQ61043 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NinQ61043 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NinQ61043 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NinQ61043 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NinQ61043 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NinQ61043 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NinQ61043 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NinQ61043 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NinQ61043 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NinQ61043 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NinQ61043 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NinQ61043 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
NinQ61043 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NinQ61043 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
NinQ61043 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NinQ61043 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
NinQ61043 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NinQ61043 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NinQ61043 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NinQ61043 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NinQ61043 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NinQ61043 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC23■■□□□ 1.27
NinQ61043 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NinQ61043 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms