Protein–RNA interactions for Protein: Q60987

Foxg1, Forkhead box protein G1, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxg1Q60987 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Foxg1Q60987 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Foxg1Q60987 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Foxg1Q60987 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Foxg1Q60987 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Foxg1Q60987 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Foxg1Q60987 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Foxg1Q60987 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Foxg1Q60987 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Foxg1Q60987 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Foxg1Q60987 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Foxg1Q60987 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Foxg1Q60987 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Foxg1Q60987 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Foxg1Q60987 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Foxg1Q60987 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Foxg1Q60987 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Foxg1Q60987 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Foxg1Q60987 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Foxg1Q60987 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Foxg1Q60987 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Foxg1Q60987 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Foxg1Q60987 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Foxg1Q60987 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Foxg1Q60987 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Foxg1Q60987 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Foxg1Q60987 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Foxg1Q60987 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Foxg1Q60987 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Foxg1Q60987 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Foxg1Q60987 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Foxg1Q60987 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Foxg1Q60987 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Foxg1Q60987 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Foxg1Q60987 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Foxg1Q60987 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Foxg1Q60987 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Foxg1Q60987 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Foxg1Q60987 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Foxg1Q60987 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Foxg1Q60987 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Foxg1Q60987 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Foxg1Q60987 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Foxg1Q60987 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Foxg1Q60987 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Foxg1Q60987 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Foxg1Q60987 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Foxg1Q60987 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Foxg1Q60987 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Foxg1Q60987 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Foxg1Q60987 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Foxg1Q60987 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Foxg1Q60987 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Foxg1Q60987 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Foxg1Q60987 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Foxg1Q60987 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Foxg1Q60987 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Foxg1Q60987 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Foxg1Q60987 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Foxg1Q60987 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Foxg1Q60987 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Foxg1Q60987 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
Foxg1Q60987 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Foxg1Q60987 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Foxg1Q60987 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Foxg1Q60987 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Foxg1Q60987 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Foxg1Q60987 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Foxg1Q60987 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Foxg1Q60987 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Foxg1Q60987 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Foxg1Q60987 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Foxg1Q60987 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Foxg1Q60987 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Foxg1Q60987 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Foxg1Q60987 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Foxg1Q60987 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Foxg1Q60987 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Foxg1Q60987 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Foxg1Q60987 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Foxg1Q60987 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Foxg1Q60987 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Foxg1Q60987 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Foxg1Q60987 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Foxg1Q60987 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Foxg1Q60987 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Foxg1Q60987 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Foxg1Q60987 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Foxg1Q60987 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Foxg1Q60987 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Foxg1Q60987 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Foxg1Q60987 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Foxg1Q60987 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Foxg1Q60987 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Foxg1Q60987 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Foxg1Q60987 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Foxg1Q60987 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Foxg1Q60987 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Foxg1Q60987 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Foxg1Q60987 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms