Protein–RNA interactions for Protein: Q60960

Kpna1, Importin subunit alpha-5, mousemouse

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kpna1Q60960 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Kpna1Q60960 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Kpna1Q60960 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Kpna1Q60960 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Kpna1Q60960 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Kpna1Q60960 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Kpna1Q60960 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Kpna1Q60960 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Kpna1Q60960 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Kpna1Q60960 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Kpna1Q60960 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Kpna1Q60960 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Kpna1Q60960 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Kpna1Q60960 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Kpna1Q60960 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Kpna1Q60960 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Kpna1Q60960 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Kpna1Q60960 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Kpna1Q60960 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Kpna1Q60960 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Kpna1Q60960 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Kpna1Q60960 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Kpna1Q60960 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Kpna1Q60960 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Kpna1Q60960 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Kpna1Q60960 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Kpna1Q60960 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Kpna1Q60960 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Kpna1Q60960 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Kpna1Q60960 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Kpna1Q60960 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Kpna1Q60960 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Kpna1Q60960 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Kpna1Q60960 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Kpna1Q60960 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Kpna1Q60960 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Kpna1Q60960 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Kpna1Q60960 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Kpna1Q60960 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Kpna1Q60960 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
Kpna1Q60960 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Kpna1Q60960 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Kpna1Q60960 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Kpna1Q60960 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Kpna1Q60960 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Kpna1Q60960 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Kpna1Q60960 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Kpna1Q60960 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Kpna1Q60960 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Kpna1Q60960 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Kpna1Q60960 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Kpna1Q60960 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Kpna1Q60960 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Kpna1Q60960 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Kpna1Q60960 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Kpna1Q60960 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Kpna1Q60960 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Kpna1Q60960 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Kpna1Q60960 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Kpna1Q60960 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Kpna1Q60960 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Kpna1Q60960 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Kpna1Q60960 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Kpna1Q60960 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Kpna1Q60960 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Kpna1Q60960 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Kpna1Q60960 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Kpna1Q60960 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Kpna1Q60960 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Kpna1Q60960 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Kpna1Q60960 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Kpna1Q60960 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Kpna1Q60960 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Kpna1Q60960 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Kpna1Q60960 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Kpna1Q60960 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Kpna1Q60960 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Kpna1Q60960 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Kpna1Q60960 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Kpna1Q60960 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Kpna1Q60960 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Kpna1Q60960 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Kpna1Q60960 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Kpna1Q60960 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Kpna1Q60960 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Kpna1Q60960 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Kpna1Q60960 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Kpna1Q60960 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Kpna1Q60960 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Kpna1Q60960 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Kpna1Q60960 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Kpna1Q60960 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Kpna1Q60960 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Kpna1Q60960 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Kpna1Q60960 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Kpna1Q60960 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Kpna1Q60960 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Kpna1Q60960 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Kpna1Q60960 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Kpna1Q60960 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms