Protein–RNA interactions for Protein: Q60772

Cdkn2c, Cyclin-dependent kinase 4 inhibitor C, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn2cQ60772 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cdkn2cQ60772 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Cdkn2cQ60772 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cdkn2cQ60772 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cdkn2cQ60772 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cdkn2cQ60772 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cdkn2cQ60772 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cdkn2cQ60772 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cdkn2cQ60772 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cdkn2cQ60772 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cdkn2cQ60772 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cdkn2cQ60772 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cdkn2cQ60772 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cdkn2cQ60772 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cdkn2cQ60772 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cdkn2cQ60772 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cdkn2cQ60772 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cdkn2cQ60772 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cdkn2cQ60772 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cdkn2cQ60772 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cdkn2cQ60772 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cdkn2cQ60772 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cdkn2cQ60772 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cdkn2cQ60772 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cdkn2cQ60772 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cdkn2cQ60772 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cdkn2cQ60772 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cdkn2cQ60772 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cdkn2cQ60772 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cdkn2cQ60772 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cdkn2cQ60772 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cdkn2cQ60772 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cdkn2cQ60772 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cdkn2cQ60772 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cdkn2cQ60772 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Cdkn2cQ60772 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cdkn2cQ60772 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cdkn2cQ60772 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cdkn2cQ60772 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cdkn2cQ60772 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cdkn2cQ60772 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cdkn2cQ60772 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cdkn2cQ60772 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cdkn2cQ60772 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cdkn2cQ60772 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cdkn2cQ60772 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cdkn2cQ60772 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cdkn2cQ60772 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cdkn2cQ60772 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cdkn2cQ60772 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cdkn2cQ60772 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cdkn2cQ60772 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cdkn2cQ60772 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Cdkn2cQ60772 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cdkn2cQ60772 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cdkn2cQ60772 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cdkn2cQ60772 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cdkn2cQ60772 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cdkn2cQ60772 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cdkn2cQ60772 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cdkn2cQ60772 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cdkn2cQ60772 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cdkn2cQ60772 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cdkn2cQ60772 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Cdkn2cQ60772 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cdkn2cQ60772 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cdkn2cQ60772 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cdkn2cQ60772 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cdkn2cQ60772 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cdkn2cQ60772 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cdkn2cQ60772 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cdkn2cQ60772 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cdkn2cQ60772 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cdkn2cQ60772 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cdkn2cQ60772 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cdkn2cQ60772 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cdkn2cQ60772 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cdkn2cQ60772 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cdkn2cQ60772 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Cdkn2cQ60772 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cdkn2cQ60772 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cdkn2cQ60772 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cdkn2cQ60772 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cdkn2cQ60772 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cdkn2cQ60772 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cdkn2cQ60772 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cdkn2cQ60772 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cdkn2cQ60772 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cdkn2cQ60772 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cdkn2cQ60772 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cdkn2cQ60772 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cdkn2cQ60772 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cdkn2cQ60772 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cdkn2cQ60772 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Cdkn2cQ60772 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cdkn2cQ60772 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cdkn2cQ60772 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cdkn2cQ60772 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cdkn2cQ60772 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Cdkn2cQ60772 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms