Protein–RNA interactions for Protein: Q60770

Stxbp3, Syntaxin-binding protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 592 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stxbp3Q60770 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Stxbp3Q60770 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Stxbp3Q60770 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Stxbp3Q60770 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Stxbp3Q60770 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Stxbp3Q60770 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Stxbp3Q60770 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Stxbp3Q60770 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Stxbp3Q60770 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Stxbp3Q60770 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Stxbp3Q60770 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Stxbp3Q60770 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Stxbp3Q60770 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Stxbp3Q60770 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Stxbp3Q60770 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Stxbp3Q60770 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Stxbp3Q60770 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Stxbp3Q60770 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Stxbp3Q60770 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Stxbp3Q60770 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Stxbp3Q60770 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Stxbp3Q60770 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Stxbp3Q60770 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Stxbp3Q60770 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Stxbp3Q60770 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Stxbp3Q60770 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Stxbp3Q60770 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Stxbp3Q60770 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Stxbp3Q60770 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Stxbp3Q60770 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Stxbp3Q60770 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Stxbp3Q60770 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Stxbp3Q60770 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Stxbp3Q60770 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Stxbp3Q60770 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Stxbp3Q60770 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Stxbp3Q60770 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Stxbp3Q60770 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Stxbp3Q60770 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Stxbp3Q60770 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Stxbp3Q60770 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Stxbp3Q60770 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Stxbp3Q60770 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Stxbp3Q60770 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Stxbp3Q60770 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Stxbp3Q60770 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Stxbp3Q60770 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Stxbp3Q60770 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Stxbp3Q60770 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Stxbp3Q60770 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Stxbp3Q60770 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Stxbp3Q60770 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Stxbp3Q60770 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Stxbp3Q60770 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Stxbp3Q60770 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Stxbp3Q60770 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Stxbp3Q60770 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Stxbp3Q60770 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Stxbp3Q60770 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Stxbp3Q60770 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Stxbp3Q60770 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Stxbp3Q60770 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Stxbp3Q60770 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Stxbp3Q60770 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Stxbp3Q60770 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Stxbp3Q60770 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Stxbp3Q60770 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Stxbp3Q60770 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Stxbp3Q60770 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Stxbp3Q60770 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Stxbp3Q60770 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Stxbp3Q60770 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Stxbp3Q60770 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Stxbp3Q60770 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Stxbp3Q60770 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Stxbp3Q60770 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Stxbp3Q60770 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Stxbp3Q60770 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Stxbp3Q60770 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Stxbp3Q60770 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Stxbp3Q60770 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Stxbp3Q60770 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Stxbp3Q60770 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Stxbp3Q60770 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Stxbp3Q60770 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Stxbp3Q60770 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Stxbp3Q60770 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Stxbp3Q60770 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Stxbp3Q60770 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Stxbp3Q60770 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Stxbp3Q60770 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Stxbp3Q60770 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Stxbp3Q60770 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Stxbp3Q60770 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Stxbp3Q60770 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Stxbp3Q60770 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Stxbp3Q60770 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Stxbp3Q60770 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Stxbp3Q60770 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Stxbp3Q60770 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms