Protein–RNA interactions for Protein: Q60722

Tcf4, Transcription factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcf4Q60722 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tcf4Q60722 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tcf4Q60722 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.87
Tcf4Q60722 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tcf4Q60722 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tcf4Q60722 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tcf4Q60722 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tcf4Q60722 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tcf4Q60722 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tcf4Q60722 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tcf4Q60722 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tcf4Q60722 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tcf4Q60722 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tcf4Q60722 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tcf4Q60722 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tcf4Q60722 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tcf4Q60722 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tcf4Q60722 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tcf4Q60722 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tcf4Q60722 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tcf4Q60722 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tcf4Q60722 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tcf4Q60722 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tcf4Q60722 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tcf4Q60722 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tcf4Q60722 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tcf4Q60722 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tcf4Q60722 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tcf4Q60722 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tcf4Q60722 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tcf4Q60722 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tcf4Q60722 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tcf4Q60722 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tcf4Q60722 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tcf4Q60722 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tcf4Q60722 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tcf4Q60722 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tcf4Q60722 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tcf4Q60722 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Tcf4Q60722 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tcf4Q60722 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tcf4Q60722 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tcf4Q60722 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tcf4Q60722 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tcf4Q60722 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tcf4Q60722 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tcf4Q60722 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tcf4Q60722 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tcf4Q60722 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tcf4Q60722 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tcf4Q60722 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tcf4Q60722 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tcf4Q60722 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tcf4Q60722 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tcf4Q60722 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tcf4Q60722 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tcf4Q60722 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tcf4Q60722 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tcf4Q60722 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tcf4Q60722 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Tcf4Q60722 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Tcf4Q60722 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tcf4Q60722 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tcf4Q60722 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tcf4Q60722 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tcf4Q60722 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tcf4Q60722 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Tcf4Q60722 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tcf4Q60722 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tcf4Q60722 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tcf4Q60722 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tcf4Q60722 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tcf4Q60722 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tcf4Q60722 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tcf4Q60722 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tcf4Q60722 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tcf4Q60722 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tcf4Q60722 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tcf4Q60722 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tcf4Q60722 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tcf4Q60722 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tcf4Q60722 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tcf4Q60722 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tcf4Q60722 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tcf4Q60722 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tcf4Q60722 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tcf4Q60722 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tcf4Q60722 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tcf4Q60722 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tcf4Q60722 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tcf4Q60722 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tcf4Q60722 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tcf4Q60722 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tcf4Q60722 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tcf4Q60722 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tcf4Q60722 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tcf4Q60722 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tcf4Q60722 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tcf4Q60722 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tcf4Q60722 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms