Protein–RNA interactions for Protein: Q60720

Cyb561, Cytochrome b561, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyb561Q60720 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cyb561Q60720 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Cyb561Q60720 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cyb561Q60720 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cyb561Q60720 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cyb561Q60720 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cyb561Q60720 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cyb561Q60720 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cyb561Q60720 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cyb561Q60720 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cyb561Q60720 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cyb561Q60720 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cyb561Q60720 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cyb561Q60720 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cyb561Q60720 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cyb561Q60720 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cyb561Q60720 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cyb561Q60720 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cyb561Q60720 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cyb561Q60720 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cyb561Q60720 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cyb561Q60720 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cyb561Q60720 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cyb561Q60720 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cyb561Q60720 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cyb561Q60720 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cyb561Q60720 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cyb561Q60720 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cyb561Q60720 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cyb561Q60720 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cyb561Q60720 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cyb561Q60720 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cyb561Q60720 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cyb561Q60720 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cyb561Q60720 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cyb561Q60720 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Cyb561Q60720 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cyb561Q60720 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cyb561Q60720 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cyb561Q60720 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cyb561Q60720 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cyb561Q60720 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cyb561Q60720 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Cyb561Q60720 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cyb561Q60720 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cyb561Q60720 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cyb561Q60720 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cyb561Q60720 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cyb561Q60720 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cyb561Q60720 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cyb561Q60720 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cyb561Q60720 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cyb561Q60720 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cyb561Q60720 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cyb561Q60720 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cyb561Q60720 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cyb561Q60720 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cyb561Q60720 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cyb561Q60720 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cyb561Q60720 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cyb561Q60720 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cyb561Q60720 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cyb561Q60720 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cyb561Q60720 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cyb561Q60720 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cyb561Q60720 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Cyb561Q60720 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Cyb561Q60720 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
Cyb561Q60720 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Cyb561Q60720 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cyb561Q60720 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cyb561Q60720 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cyb561Q60720 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cyb561Q60720 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cyb561Q60720 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cyb561Q60720 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cyb561Q60720 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Cyb561Q60720 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Cyb561Q60720 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cyb561Q60720 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Cyb561Q60720 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cyb561Q60720 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cyb561Q60720 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cyb561Q60720 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cyb561Q60720 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cyb561Q60720 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cyb561Q60720 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Cyb561Q60720 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cyb561Q60720 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cyb561Q60720 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cyb561Q60720 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cyb561Q60720 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cyb561Q60720 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cyb561Q60720 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cyb561Q60720 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cyb561Q60720 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cyb561Q60720 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Cyb561Q60720 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cyb561Q60720 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cyb561Q60720 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms