Protein–RNA interactions for Protein: Q60673

Ptprn, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprnQ60673 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PtprnQ60673 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PtprnQ60673 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PtprnQ60673 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PtprnQ60673 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PtprnQ60673 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PtprnQ60673 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PtprnQ60673 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PtprnQ60673 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PtprnQ60673 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PtprnQ60673 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PtprnQ60673 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PtprnQ60673 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PtprnQ60673 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PtprnQ60673 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PtprnQ60673 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PtprnQ60673 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PtprnQ60673 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PtprnQ60673 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PtprnQ60673 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PtprnQ60673 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PtprnQ60673 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PtprnQ60673 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PtprnQ60673 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PtprnQ60673 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
PtprnQ60673 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PtprnQ60673 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PtprnQ60673 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PtprnQ60673 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PtprnQ60673 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PtprnQ60673 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PtprnQ60673 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PtprnQ60673 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
PtprnQ60673 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PtprnQ60673 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PtprnQ60673 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PtprnQ60673 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PtprnQ60673 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PtprnQ60673 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PtprnQ60673 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PtprnQ60673 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PtprnQ60673 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
PtprnQ60673 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PtprnQ60673 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PtprnQ60673 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PtprnQ60673 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PtprnQ60673 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PtprnQ60673 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PtprnQ60673 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PtprnQ60673 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PtprnQ60673 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PtprnQ60673 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PtprnQ60673 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PtprnQ60673 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PtprnQ60673 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PtprnQ60673 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PtprnQ60673 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PtprnQ60673 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PtprnQ60673 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PtprnQ60673 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PtprnQ60673 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PtprnQ60673 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
PtprnQ60673 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PtprnQ60673 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PtprnQ60673 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PtprnQ60673 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PtprnQ60673 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PtprnQ60673 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PtprnQ60673 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
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PtprnQ60673 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PtprnQ60673 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PtprnQ60673 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PtprnQ60673 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PtprnQ60673 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PtprnQ60673 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PtprnQ60673 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PtprnQ60673 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
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PtprnQ60673 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PtprnQ60673 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PtprnQ60673 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PtprnQ60673 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PtprnQ60673 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
PtprnQ60673 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PtprnQ60673 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PtprnQ60673 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PtprnQ60673 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PtprnQ60673 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PtprnQ60673 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PtprnQ60673 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PtprnQ60673 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PtprnQ60673 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PtprnQ60673 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PtprnQ60673 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PtprnQ60673 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PtprnQ60673 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PtprnQ60673 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PtprnQ60673 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PtprnQ60673 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.4 ms