Protein–RNA interactions for Protein: Q5SV77

Ggnbp2, Gametogenetin-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 696 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggnbp2Q5SV77 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Ggnbp2Q5SV77 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ggnbp2Q5SV77 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ggnbp2Q5SV77 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ggnbp2Q5SV77 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ggnbp2Q5SV77 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Ggnbp2Q5SV77 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ggnbp2Q5SV77 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ggnbp2Q5SV77 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Ggnbp2Q5SV77 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ggnbp2Q5SV77 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ggnbp2Q5SV77 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ggnbp2Q5SV77 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ggnbp2Q5SV77 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Ggnbp2Q5SV77 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Ggnbp2Q5SV77 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ggnbp2Q5SV77 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ggnbp2Q5SV77 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ggnbp2Q5SV77 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ggnbp2Q5SV77 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ggnbp2Q5SV77 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ggnbp2Q5SV77 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ggnbp2Q5SV77 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ggnbp2Q5SV77 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ggnbp2Q5SV77 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ggnbp2Q5SV77 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ggnbp2Q5SV77 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ggnbp2Q5SV77 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ggnbp2Q5SV77 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ggnbp2Q5SV77 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ggnbp2Q5SV77 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ggnbp2Q5SV77 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ggnbp2Q5SV77 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ggnbp2Q5SV77 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ggnbp2Q5SV77 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Ggnbp2Q5SV77 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ggnbp2Q5SV77 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ggnbp2Q5SV77 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ggnbp2Q5SV77 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ggnbp2Q5SV77 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ggnbp2Q5SV77 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ggnbp2Q5SV77 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ggnbp2Q5SV77 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ggnbp2Q5SV77 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ggnbp2Q5SV77 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ggnbp2Q5SV77 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ggnbp2Q5SV77 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ggnbp2Q5SV77 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ggnbp2Q5SV77 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Ggnbp2Q5SV77 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Ggnbp2Q5SV77 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Ggnbp2Q5SV77 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ggnbp2Q5SV77 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ggnbp2Q5SV77 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ggnbp2Q5SV77 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ggnbp2Q5SV77 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ggnbp2Q5SV77 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Ggnbp2Q5SV77 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ggnbp2Q5SV77 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ggnbp2Q5SV77 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ggnbp2Q5SV77 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Ggnbp2Q5SV77 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ggnbp2Q5SV77 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ggnbp2Q5SV77 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ggnbp2Q5SV77 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ggnbp2Q5SV77 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Ggnbp2Q5SV77 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Ggnbp2Q5SV77 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ggnbp2Q5SV77 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ggnbp2Q5SV77 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ggnbp2Q5SV77 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Ggnbp2Q5SV77 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ggnbp2Q5SV77 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ggnbp2Q5SV77 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ggnbp2Q5SV77 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ggnbp2Q5SV77 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ggnbp2Q5SV77 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ggnbp2Q5SV77 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ggnbp2Q5SV77 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ggnbp2Q5SV77 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Ggnbp2Q5SV77 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ggnbp2Q5SV77 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ggnbp2Q5SV77 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ggnbp2Q5SV77 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ggnbp2Q5SV77 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ggnbp2Q5SV77 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ggnbp2Q5SV77 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ggnbp2Q5SV77 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Ggnbp2Q5SV77 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ggnbp2Q5SV77 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ggnbp2Q5SV77 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ggnbp2Q5SV77 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ggnbp2Q5SV77 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ggnbp2Q5SV77 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ggnbp2Q5SV77 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ggnbp2Q5SV77 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ggnbp2Q5SV77 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ggnbp2Q5SV77 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ggnbp2Q5SV77 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ggnbp2Q5SV77 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms