Protein–RNA interactions for Protein: Q5SUD9

Bbs12, Bardet-Biedl syndrome 12 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bbs12Q5SUD9 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Bbs12Q5SUD9 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Bbs12Q5SUD9 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Bbs12Q5SUD9 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Bbs12Q5SUD9 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Bbs12Q5SUD9 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Bbs12Q5SUD9 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Bbs12Q5SUD9 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Bbs12Q5SUD9 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Bbs12Q5SUD9 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Bbs12Q5SUD9 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Bbs12Q5SUD9 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Bbs12Q5SUD9 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Bbs12Q5SUD9 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Bbs12Q5SUD9 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Bbs12Q5SUD9 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Bbs12Q5SUD9 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Bbs12Q5SUD9 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Bbs12Q5SUD9 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Bbs12Q5SUD9 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Bbs12Q5SUD9 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Bbs12Q5SUD9 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Bbs12Q5SUD9 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Bbs12Q5SUD9 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Bbs12Q5SUD9 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Bbs12Q5SUD9 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Bbs12Q5SUD9 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Bbs12Q5SUD9 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Bbs12Q5SUD9 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Bbs12Q5SUD9 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Bbs12Q5SUD9 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Bbs12Q5SUD9 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Bbs12Q5SUD9 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Bbs12Q5SUD9 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Bbs12Q5SUD9 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Bbs12Q5SUD9 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Bbs12Q5SUD9 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Bbs12Q5SUD9 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Bbs12Q5SUD9 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Bbs12Q5SUD9 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Bbs12Q5SUD9 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Bbs12Q5SUD9 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Bbs12Q5SUD9 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Bbs12Q5SUD9 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Bbs12Q5SUD9 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Bbs12Q5SUD9 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Bbs12Q5SUD9 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Bbs12Q5SUD9 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Bbs12Q5SUD9 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Bbs12Q5SUD9 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Bbs12Q5SUD9 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Bbs12Q5SUD9 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Bbs12Q5SUD9 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Bbs12Q5SUD9 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Bbs12Q5SUD9 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Bbs12Q5SUD9 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Bbs12Q5SUD9 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Bbs12Q5SUD9 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Bbs12Q5SUD9 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Bbs12Q5SUD9 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Bbs12Q5SUD9 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Bbs12Q5SUD9 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Bbs12Q5SUD9 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Bbs12Q5SUD9 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Bbs12Q5SUD9 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Bbs12Q5SUD9 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Bbs12Q5SUD9 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Bbs12Q5SUD9 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Bbs12Q5SUD9 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Bbs12Q5SUD9 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Bbs12Q5SUD9 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Bbs12Q5SUD9 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Bbs12Q5SUD9 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Bbs12Q5SUD9 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Bbs12Q5SUD9 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Bbs12Q5SUD9 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Bbs12Q5SUD9 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Bbs12Q5SUD9 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Bbs12Q5SUD9 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Bbs12Q5SUD9 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Bbs12Q5SUD9 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Bbs12Q5SUD9 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Bbs12Q5SUD9 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Bbs12Q5SUD9 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Bbs12Q5SUD9 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Bbs12Q5SUD9 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Bbs12Q5SUD9 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Bbs12Q5SUD9 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Bbs12Q5SUD9 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Bbs12Q5SUD9 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Bbs12Q5SUD9 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Bbs12Q5SUD9 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Bbs12Q5SUD9 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Bbs12Q5SUD9 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Bbs12Q5SUD9 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Bbs12Q5SUD9 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Bbs12Q5SUD9 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Bbs12Q5SUD9 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Bbs12Q5SUD9 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Bbs12Q5SUD9 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms