Protein–RNA interactions for Protein: Q5SQK8

4930512M02Rik, RIKEN cDNA 4930512M02 gene, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930512M02RikQ5SQK8 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
4930512M02RikQ5SQK8 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
4930512M02RikQ5SQK8 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
4930512M02RikQ5SQK8 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
4930512M02RikQ5SQK8 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
4930512M02RikQ5SQK8 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
4930512M02RikQ5SQK8 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
4930512M02RikQ5SQK8 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
4930512M02RikQ5SQK8 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
4930512M02RikQ5SQK8 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
4930512M02RikQ5SQK8 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
4930512M02RikQ5SQK8 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
4930512M02RikQ5SQK8 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
4930512M02RikQ5SQK8 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
4930512M02RikQ5SQK8 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
4930512M02RikQ5SQK8 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
4930512M02RikQ5SQK8 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
4930512M02RikQ5SQK8 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
4930512M02RikQ5SQK8 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
4930512M02RikQ5SQK8 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
4930512M02RikQ5SQK8 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
4930512M02RikQ5SQK8 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
4930512M02RikQ5SQK8 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
4930512M02RikQ5SQK8 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
4930512M02RikQ5SQK8 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
4930512M02RikQ5SQK8 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
4930512M02RikQ5SQK8 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
4930512M02RikQ5SQK8 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
4930512M02RikQ5SQK8 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
4930512M02RikQ5SQK8 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
4930512M02RikQ5SQK8 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
4930512M02RikQ5SQK8 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
4930512M02RikQ5SQK8 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
4930512M02RikQ5SQK8 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
4930512M02RikQ5SQK8 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
4930512M02RikQ5SQK8 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
4930512M02RikQ5SQK8 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
4930512M02RikQ5SQK8 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
4930512M02RikQ5SQK8 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
4930512M02RikQ5SQK8 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
4930512M02RikQ5SQK8 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
4930512M02RikQ5SQK8 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
4930512M02RikQ5SQK8 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
4930512M02RikQ5SQK8 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
4930512M02RikQ5SQK8 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
4930512M02RikQ5SQK8 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
4930512M02RikQ5SQK8 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
4930512M02RikQ5SQK8 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
4930512M02RikQ5SQK8 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
4930512M02RikQ5SQK8 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
4930512M02RikQ5SQK8 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
4930512M02RikQ5SQK8 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
4930512M02RikQ5SQK8 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
4930512M02RikQ5SQK8 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
4930512M02RikQ5SQK8 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
4930512M02RikQ5SQK8 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
4930512M02RikQ5SQK8 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
4930512M02RikQ5SQK8 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
4930512M02RikQ5SQK8 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
4930512M02RikQ5SQK8 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
4930512M02RikQ5SQK8 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
4930512M02RikQ5SQK8 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
4930512M02RikQ5SQK8 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
4930512M02RikQ5SQK8 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
4930512M02RikQ5SQK8 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
4930512M02RikQ5SQK8 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
4930512M02RikQ5SQK8 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
4930512M02RikQ5SQK8 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
4930512M02RikQ5SQK8 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
4930512M02RikQ5SQK8 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
4930512M02RikQ5SQK8 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
4930512M02RikQ5SQK8 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
4930512M02RikQ5SQK8 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
4930512M02RikQ5SQK8 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
4930512M02RikQ5SQK8 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
4930512M02RikQ5SQK8 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
4930512M02RikQ5SQK8 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
4930512M02RikQ5SQK8 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
4930512M02RikQ5SQK8 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
4930512M02RikQ5SQK8 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
4930512M02RikQ5SQK8 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
4930512M02RikQ5SQK8 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
4930512M02RikQ5SQK8 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
4930512M02RikQ5SQK8 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
4930512M02RikQ5SQK8 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
4930512M02RikQ5SQK8 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
4930512M02RikQ5SQK8 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
4930512M02RikQ5SQK8 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
4930512M02RikQ5SQK8 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
4930512M02RikQ5SQK8 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
4930512M02RikQ5SQK8 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
4930512M02RikQ5SQK8 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
4930512M02RikQ5SQK8 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
4930512M02RikQ5SQK8 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
4930512M02RikQ5SQK8 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
4930512M02RikQ5SQK8 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
4930512M02RikQ5SQK8 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
4930512M02RikQ5SQK8 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
4930512M02RikQ5SQK8 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
4930512M02RikQ5SQK8 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms