Protein–RNA interactions for Protein: Q5ND28

Scarf1, Scavenger receptor class F member 1, mousemouse

Predictions only

Length 820 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scarf1Q5ND28 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Scarf1Q5ND28 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Scarf1Q5ND28 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Scarf1Q5ND28 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Scarf1Q5ND28 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Scarf1Q5ND28 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Scarf1Q5ND28 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Scarf1Q5ND28 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Scarf1Q5ND28 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Scarf1Q5ND28 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Scarf1Q5ND28 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Scarf1Q5ND28 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Scarf1Q5ND28 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Scarf1Q5ND28 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Scarf1Q5ND28 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Scarf1Q5ND28 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Scarf1Q5ND28 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Scarf1Q5ND28 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Scarf1Q5ND28 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Scarf1Q5ND28 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Scarf1Q5ND28 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Scarf1Q5ND28 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Scarf1Q5ND28 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Scarf1Q5ND28 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Scarf1Q5ND28 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Scarf1Q5ND28 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Scarf1Q5ND28 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Scarf1Q5ND28 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Scarf1Q5ND28 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Scarf1Q5ND28 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Scarf1Q5ND28 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Scarf1Q5ND28 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Scarf1Q5ND28 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Scarf1Q5ND28 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Scarf1Q5ND28 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Scarf1Q5ND28 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Scarf1Q5ND28 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Scarf1Q5ND28 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Scarf1Q5ND28 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Scarf1Q5ND28 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Scarf1Q5ND28 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Scarf1Q5ND28 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Scarf1Q5ND28 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Scarf1Q5ND28 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Scarf1Q5ND28 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Scarf1Q5ND28 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Scarf1Q5ND28 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Scarf1Q5ND28 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Scarf1Q5ND28 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Scarf1Q5ND28 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Scarf1Q5ND28 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Scarf1Q5ND28 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Scarf1Q5ND28 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Scarf1Q5ND28 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Scarf1Q5ND28 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Scarf1Q5ND28 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Scarf1Q5ND28 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Scarf1Q5ND28 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Scarf1Q5ND28 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Scarf1Q5ND28 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Scarf1Q5ND28 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Scarf1Q5ND28 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Scarf1Q5ND28 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Scarf1Q5ND28 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Scarf1Q5ND28 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Scarf1Q5ND28 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Scarf1Q5ND28 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Scarf1Q5ND28 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Scarf1Q5ND28 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Scarf1Q5ND28 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Scarf1Q5ND28 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Scarf1Q5ND28 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Scarf1Q5ND28 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Scarf1Q5ND28 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Scarf1Q5ND28 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Scarf1Q5ND28 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Scarf1Q5ND28 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Scarf1Q5ND28 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Scarf1Q5ND28 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Scarf1Q5ND28 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Scarf1Q5ND28 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Scarf1Q5ND28 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Scarf1Q5ND28 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Scarf1Q5ND28 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Scarf1Q5ND28 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Scarf1Q5ND28 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Scarf1Q5ND28 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Scarf1Q5ND28 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Scarf1Q5ND28 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Scarf1Q5ND28 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Scarf1Q5ND28 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Scarf1Q5ND28 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Scarf1Q5ND28 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Scarf1Q5ND28 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Scarf1Q5ND28 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Scarf1Q5ND28 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Scarf1Q5ND28 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Scarf1Q5ND28 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Scarf1Q5ND28 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Scarf1Q5ND28 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
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