Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCR9

Nsrp1, Nuclear speckle splicing regulatory protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 542 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nsrp1Q5NCR9 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nsrp1Q5NCR9 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nsrp1Q5NCR9 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nsrp1Q5NCR9 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nsrp1Q5NCR9 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nsrp1Q5NCR9 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nsrp1Q5NCR9 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nsrp1Q5NCR9 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nsrp1Q5NCR9 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nsrp1Q5NCR9 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nsrp1Q5NCR9 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nsrp1Q5NCR9 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nsrp1Q5NCR9 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nsrp1Q5NCR9 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nsrp1Q5NCR9 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nsrp1Q5NCR9 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nsrp1Q5NCR9 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nsrp1Q5NCR9 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nsrp1Q5NCR9 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nsrp1Q5NCR9 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nsrp1Q5NCR9 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nsrp1Q5NCR9 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nsrp1Q5NCR9 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nsrp1Q5NCR9 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nsrp1Q5NCR9 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nsrp1Q5NCR9 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nsrp1Q5NCR9 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nsrp1Q5NCR9 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nsrp1Q5NCR9 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Nsrp1Q5NCR9 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Nsrp1Q5NCR9 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nsrp1Q5NCR9 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nsrp1Q5NCR9 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nsrp1Q5NCR9 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Nsrp1Q5NCR9 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nsrp1Q5NCR9 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nsrp1Q5NCR9 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nsrp1Q5NCR9 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nsrp1Q5NCR9 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nsrp1Q5NCR9 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nsrp1Q5NCR9 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nsrp1Q5NCR9 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nsrp1Q5NCR9 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nsrp1Q5NCR9 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nsrp1Q5NCR9 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nsrp1Q5NCR9 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nsrp1Q5NCR9 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nsrp1Q5NCR9 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nsrp1Q5NCR9 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nsrp1Q5NCR9 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nsrp1Q5NCR9 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nsrp1Q5NCR9 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nsrp1Q5NCR9 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nsrp1Q5NCR9 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nsrp1Q5NCR9 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nsrp1Q5NCR9 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nsrp1Q5NCR9 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Nsrp1Q5NCR9 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nsrp1Q5NCR9 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nsrp1Q5NCR9 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nsrp1Q5NCR9 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nsrp1Q5NCR9 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nsrp1Q5NCR9 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nsrp1Q5NCR9 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nsrp1Q5NCR9 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nsrp1Q5NCR9 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nsrp1Q5NCR9 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nsrp1Q5NCR9 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nsrp1Q5NCR9 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nsrp1Q5NCR9 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nsrp1Q5NCR9 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nsrp1Q5NCR9 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nsrp1Q5NCR9 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nsrp1Q5NCR9 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nsrp1Q5NCR9 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nsrp1Q5NCR9 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nsrp1Q5NCR9 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nsrp1Q5NCR9 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nsrp1Q5NCR9 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nsrp1Q5NCR9 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nsrp1Q5NCR9 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nsrp1Q5NCR9 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nsrp1Q5NCR9 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nsrp1Q5NCR9 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nsrp1Q5NCR9 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nsrp1Q5NCR9 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Nsrp1Q5NCR9 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nsrp1Q5NCR9 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nsrp1Q5NCR9 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Nsrp1Q5NCR9 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nsrp1Q5NCR9 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nsrp1Q5NCR9 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Nsrp1Q5NCR9 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nsrp1Q5NCR9 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nsrp1Q5NCR9 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Nsrp1Q5NCR9 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nsrp1Q5NCR9 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nsrp1Q5NCR9 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nsrp1Q5NCR9 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nsrp1Q5NCR9 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms