Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCJ1

Rapgef6, Rap guanine nucleotide exchange factor (GEF) 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,609 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rapgef6Q5NCJ1 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Rapgef6Q5NCJ1 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Rapgef6Q5NCJ1 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Rapgef6Q5NCJ1 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Rapgef6Q5NCJ1 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
Rapgef6Q5NCJ1 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
Rapgef6Q5NCJ1 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Rapgef6Q5NCJ1 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Rapgef6Q5NCJ1 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Rapgef6Q5NCJ1 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
Rapgef6Q5NCJ1 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
Rapgef6Q5NCJ1 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
Rapgef6Q5NCJ1 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Rapgef6Q5NCJ1 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Rapgef6Q5NCJ1 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Rapgef6Q5NCJ1 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
Rapgef6Q5NCJ1 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
Rapgef6Q5NCJ1 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Rapgef6Q5NCJ1 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Rapgef6Q5NCJ1 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Rapgef6Q5NCJ1 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC30.01■■■□□ 2.39
Rapgef6Q5NCJ1 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC30■■■□□ 2.39
Rapgef6Q5NCJ1 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC30■■■□□ 2.39
Rapgef6Q5NCJ1 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Rapgef6Q5NCJ1 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Rapgef6Q5NCJ1 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Rapgef6Q5NCJ1 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC30■■■□□ 2.39
Rapgef6Q5NCJ1 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Rapgef6Q5NCJ1 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC30■■■□□ 2.39
Rapgef6Q5NCJ1 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Rapgef6Q5NCJ1 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Rapgef6Q5NCJ1 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Rapgef6Q5NCJ1 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
Rapgef6Q5NCJ1 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
Rapgef6Q5NCJ1 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Rapgef6Q5NCJ1 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Rapgef6Q5NCJ1 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
Rapgef6Q5NCJ1 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Rapgef6Q5NCJ1 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Rapgef6Q5NCJ1 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC29.98■■■□□ 2.39
Rapgef6Q5NCJ1 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Rapgef6Q5NCJ1 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
Rapgef6Q5NCJ1 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
Rapgef6Q5NCJ1 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Rapgef6Q5NCJ1 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
Rapgef6Q5NCJ1 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Rapgef6Q5NCJ1 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
Rapgef6Q5NCJ1 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC29.98■■■□□ 2.39
Rapgef6Q5NCJ1 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Rapgef6Q5NCJ1 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
Rapgef6Q5NCJ1 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Rapgef6Q5NCJ1 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Rapgef6Q5NCJ1 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Rapgef6Q5NCJ1 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Rapgef6Q5NCJ1 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Rapgef6Q5NCJ1 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Rapgef6Q5NCJ1 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Rapgef6Q5NCJ1 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
Rapgef6Q5NCJ1 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Rapgef6Q5NCJ1 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC29.97■■■□□ 2.39
Rapgef6Q5NCJ1 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Rapgef6Q5NCJ1 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
Rapgef6Q5NCJ1 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Rapgef6Q5NCJ1 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Rapgef6Q5NCJ1 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Rapgef6Q5NCJ1 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
Rapgef6Q5NCJ1 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
Rapgef6Q5NCJ1 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Rapgef6Q5NCJ1 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
Rapgef6Q5NCJ1 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.38
Rapgef6Q5NCJ1 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
Rapgef6Q5NCJ1 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
Rapgef6Q5NCJ1 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Rapgef6Q5NCJ1 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
Rapgef6Q5NCJ1 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Rapgef6Q5NCJ1 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Rapgef6Q5NCJ1 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC29.93■■■□□ 2.38
Rapgef6Q5NCJ1 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Rapgef6Q5NCJ1 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Rapgef6Q5NCJ1 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Rapgef6Q5NCJ1 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Rapgef6Q5NCJ1 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Rapgef6Q5NCJ1 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
Rapgef6Q5NCJ1 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
Rapgef6Q5NCJ1 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
Rapgef6Q5NCJ1 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Rapgef6Q5NCJ1 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Rapgef6Q5NCJ1 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Rapgef6Q5NCJ1 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Rapgef6Q5NCJ1 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
Rapgef6Q5NCJ1 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Rapgef6Q5NCJ1 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Rapgef6Q5NCJ1 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Rapgef6Q5NCJ1 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
Rapgef6Q5NCJ1 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Rapgef6Q5NCJ1 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Rapgef6Q5NCJ1 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Rapgef6Q5NCJ1 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Rapgef6Q5NCJ1 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Rapgef6Q5NCJ1 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms