Protein–RNA interactions for Protein: Q5NC41

1810065E05Rik, RIKEN cDNA 1810065E05 gene, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1810065E05RikQ5NC41 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
1810065E05RikQ5NC41 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
1810065E05RikQ5NC41 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
1810065E05RikQ5NC41 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
1810065E05RikQ5NC41 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
1810065E05RikQ5NC41 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
1810065E05RikQ5NC41 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
1810065E05RikQ5NC41 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
1810065E05RikQ5NC41 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
1810065E05RikQ5NC41 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
1810065E05RikQ5NC41 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
1810065E05RikQ5NC41 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
1810065E05RikQ5NC41 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
1810065E05RikQ5NC41 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
1810065E05RikQ5NC41 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
1810065E05RikQ5NC41 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
1810065E05RikQ5NC41 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
1810065E05RikQ5NC41 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
1810065E05RikQ5NC41 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
1810065E05RikQ5NC41 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
1810065E05RikQ5NC41 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
1810065E05RikQ5NC41 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
1810065E05RikQ5NC41 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
1810065E05RikQ5NC41 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
1810065E05RikQ5NC41 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
1810065E05RikQ5NC41 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
1810065E05RikQ5NC41 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
1810065E05RikQ5NC41 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
1810065E05RikQ5NC41 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
1810065E05RikQ5NC41 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
1810065E05RikQ5NC41 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
1810065E05RikQ5NC41 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
1810065E05RikQ5NC41 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
1810065E05RikQ5NC41 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
1810065E05RikQ5NC41 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
1810065E05RikQ5NC41 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
1810065E05RikQ5NC41 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
1810065E05RikQ5NC41 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
1810065E05RikQ5NC41 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
1810065E05RikQ5NC41 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
1810065E05RikQ5NC41 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
1810065E05RikQ5NC41 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
1810065E05RikQ5NC41 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
1810065E05RikQ5NC41 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
1810065E05RikQ5NC41 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
1810065E05RikQ5NC41 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
1810065E05RikQ5NC41 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
1810065E05RikQ5NC41 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
1810065E05RikQ5NC41 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
1810065E05RikQ5NC41 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
1810065E05RikQ5NC41 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
1810065E05RikQ5NC41 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
1810065E05RikQ5NC41 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
1810065E05RikQ5NC41 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
1810065E05RikQ5NC41 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
1810065E05RikQ5NC41 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
1810065E05RikQ5NC41 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
1810065E05RikQ5NC41 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
1810065E05RikQ5NC41 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
1810065E05RikQ5NC41 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
1810065E05RikQ5NC41 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
1810065E05RikQ5NC41 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
1810065E05RikQ5NC41 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
1810065E05RikQ5NC41 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
1810065E05RikQ5NC41 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
1810065E05RikQ5NC41 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
1810065E05RikQ5NC41 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
1810065E05RikQ5NC41 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
1810065E05RikQ5NC41 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
1810065E05RikQ5NC41 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
1810065E05RikQ5NC41 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
1810065E05RikQ5NC41 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
1810065E05RikQ5NC41 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
1810065E05RikQ5NC41 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
1810065E05RikQ5NC41 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
1810065E05RikQ5NC41 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
1810065E05RikQ5NC41 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
1810065E05RikQ5NC41 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
1810065E05RikQ5NC41 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
1810065E05RikQ5NC41 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
1810065E05RikQ5NC41 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
1810065E05RikQ5NC41 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
1810065E05RikQ5NC41 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
1810065E05RikQ5NC41 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
1810065E05RikQ5NC41 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
1810065E05RikQ5NC41 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
1810065E05RikQ5NC41 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
1810065E05RikQ5NC41 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
1810065E05RikQ5NC41 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
1810065E05RikQ5NC41 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
1810065E05RikQ5NC41 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
1810065E05RikQ5NC41 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
1810065E05RikQ5NC41 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
1810065E05RikQ5NC41 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
1810065E05RikQ5NC41 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
1810065E05RikQ5NC41 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
1810065E05RikQ5NC41 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
1810065E05RikQ5NC41 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
1810065E05RikQ5NC41 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
1810065E05RikQ5NC41 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms