Protein–RNA interactions for Protein: Q5F4S9

Trpm3, Transient receptor potential cation channel, subfamily M, member 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,721 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpm3Q5F4S9 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Trpm3Q5F4S9 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Trpm3Q5F4S9 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Trpm3Q5F4S9 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Trpm3Q5F4S9 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Trpm3Q5F4S9 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Trpm3Q5F4S9 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Trpm3Q5F4S9 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Trpm3Q5F4S9 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Trpm3Q5F4S9 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Trpm3Q5F4S9 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Trpm3Q5F4S9 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Trpm3Q5F4S9 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Trpm3Q5F4S9 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Trpm3Q5F4S9 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Trpm3Q5F4S9 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Trpm3Q5F4S9 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Trpm3Q5F4S9 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Trpm3Q5F4S9 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Trpm3Q5F4S9 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Trpm3Q5F4S9 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Trpm3Q5F4S9 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Trpm3Q5F4S9 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Trpm3Q5F4S9 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Trpm3Q5F4S9 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Trpm3Q5F4S9 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Trpm3Q5F4S9 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Trpm3Q5F4S9 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Trpm3Q5F4S9 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Trpm3Q5F4S9 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Trpm3Q5F4S9 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Trpm3Q5F4S9 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Trpm3Q5F4S9 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Trpm3Q5F4S9 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Trpm3Q5F4S9 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Trpm3Q5F4S9 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Trpm3Q5F4S9 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Trpm3Q5F4S9 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Trpm3Q5F4S9 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Trpm3Q5F4S9 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Trpm3Q5F4S9 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Trpm3Q5F4S9 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Trpm3Q5F4S9 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Trpm3Q5F4S9 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Trpm3Q5F4S9 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Trpm3Q5F4S9 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Trpm3Q5F4S9 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Trpm3Q5F4S9 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Trpm3Q5F4S9 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Trpm3Q5F4S9 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Trpm3Q5F4S9 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Trpm3Q5F4S9 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Trpm3Q5F4S9 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Trpm3Q5F4S9 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Trpm3Q5F4S9 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Trpm3Q5F4S9 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Trpm3Q5F4S9 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Trpm3Q5F4S9 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Trpm3Q5F4S9 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Trpm3Q5F4S9 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Trpm3Q5F4S9 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Trpm3Q5F4S9 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Trpm3Q5F4S9 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Trpm3Q5F4S9 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Trpm3Q5F4S9 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Trpm3Q5F4S9 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Trpm3Q5F4S9 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Trpm3Q5F4S9 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Trpm3Q5F4S9 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Trpm3Q5F4S9 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Trpm3Q5F4S9 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Trpm3Q5F4S9 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Trpm3Q5F4S9 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Trpm3Q5F4S9 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Trpm3Q5F4S9 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Trpm3Q5F4S9 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Trpm3Q5F4S9 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Trpm3Q5F4S9 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Trpm3Q5F4S9 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Trpm3Q5F4S9 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Trpm3Q5F4S9 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Trpm3Q5F4S9 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Trpm3Q5F4S9 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Trpm3Q5F4S9 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Trpm3Q5F4S9 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Trpm3Q5F4S9 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Trpm3Q5F4S9 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Trpm3Q5F4S9 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Trpm3Q5F4S9 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Trpm3Q5F4S9 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Trpm3Q5F4S9 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Trpm3Q5F4S9 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Trpm3Q5F4S9 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Trpm3Q5F4S9 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Trpm3Q5F4S9 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Trpm3Q5F4S9 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Trpm3Q5F4S9 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Trpm3Q5F4S9 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Trpm3Q5F4S9 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Trpm3Q5F4S9 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms