Protein–RNA interactions for Protein: Q5DU02

Usp22, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 22, mousemouse

Predictions only

Length 525 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp22Q5DU02 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Usp22Q5DU02 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Usp22Q5DU02 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Usp22Q5DU02 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Usp22Q5DU02 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Usp22Q5DU02 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Usp22Q5DU02 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Usp22Q5DU02 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Usp22Q5DU02 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Usp22Q5DU02 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Usp22Q5DU02 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Usp22Q5DU02 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Usp22Q5DU02 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Usp22Q5DU02 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Usp22Q5DU02 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Usp22Q5DU02 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Usp22Q5DU02 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Usp22Q5DU02 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Usp22Q5DU02 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Usp22Q5DU02 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Usp22Q5DU02 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Usp22Q5DU02 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Usp22Q5DU02 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Usp22Q5DU02 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Usp22Q5DU02 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Usp22Q5DU02 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Usp22Q5DU02 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Usp22Q5DU02 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Usp22Q5DU02 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Usp22Q5DU02 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Usp22Q5DU02 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Usp22Q5DU02 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Usp22Q5DU02 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Usp22Q5DU02 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Usp22Q5DU02 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Usp22Q5DU02 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Usp22Q5DU02 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Usp22Q5DU02 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Usp22Q5DU02 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Usp22Q5DU02 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Usp22Q5DU02 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Usp22Q5DU02 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Usp22Q5DU02 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Usp22Q5DU02 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Usp22Q5DU02 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Usp22Q5DU02 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Usp22Q5DU02 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Usp22Q5DU02 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Usp22Q5DU02 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Usp22Q5DU02 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Usp22Q5DU02 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Usp22Q5DU02 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Usp22Q5DU02 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Usp22Q5DU02 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Usp22Q5DU02 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Usp22Q5DU02 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Usp22Q5DU02 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Usp22Q5DU02 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Usp22Q5DU02 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Usp22Q5DU02 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Usp22Q5DU02 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Usp22Q5DU02 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Usp22Q5DU02 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Usp22Q5DU02 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Usp22Q5DU02 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Usp22Q5DU02 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Usp22Q5DU02 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Usp22Q5DU02 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Usp22Q5DU02 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Usp22Q5DU02 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Usp22Q5DU02 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Usp22Q5DU02 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Usp22Q5DU02 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Usp22Q5DU02 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Usp22Q5DU02 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Usp22Q5DU02 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Usp22Q5DU02 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Usp22Q5DU02 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Usp22Q5DU02 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Usp22Q5DU02 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Usp22Q5DU02 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Usp22Q5DU02 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Usp22Q5DU02 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Usp22Q5DU02 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Usp22Q5DU02 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Usp22Q5DU02 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Usp22Q5DU02 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Usp22Q5DU02 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Usp22Q5DU02 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Usp22Q5DU02 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Usp22Q5DU02 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Usp22Q5DU02 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Usp22Q5DU02 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Usp22Q5DU02 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Usp22Q5DU02 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Usp22Q5DU02 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Usp22Q5DU02 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Usp22Q5DU02 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Usp22Q5DU02 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Usp22Q5DU02 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms