Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTK1

Chsy3, Chondroitin sulfate synthase 3, mousemouse

Predictions only

Length 884 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chsy3Q5DTK1 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Chsy3Q5DTK1 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Chsy3Q5DTK1 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Chsy3Q5DTK1 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Chsy3Q5DTK1 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Chsy3Q5DTK1 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Chsy3Q5DTK1 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Chsy3Q5DTK1 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Chsy3Q5DTK1 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Chsy3Q5DTK1 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Chsy3Q5DTK1 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Chsy3Q5DTK1 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Chsy3Q5DTK1 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Chsy3Q5DTK1 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Chsy3Q5DTK1 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Chsy3Q5DTK1 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Chsy3Q5DTK1 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Chsy3Q5DTK1 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Chsy3Q5DTK1 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Chsy3Q5DTK1 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Chsy3Q5DTK1 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Chsy3Q5DTK1 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Chsy3Q5DTK1 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Chsy3Q5DTK1 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Chsy3Q5DTK1 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Chsy3Q5DTK1 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Chsy3Q5DTK1 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Chsy3Q5DTK1 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Chsy3Q5DTK1 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Chsy3Q5DTK1 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Chsy3Q5DTK1 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Chsy3Q5DTK1 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Chsy3Q5DTK1 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Chsy3Q5DTK1 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Chsy3Q5DTK1 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Chsy3Q5DTK1 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Chsy3Q5DTK1 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Chsy3Q5DTK1 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Chsy3Q5DTK1 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Chsy3Q5DTK1 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Chsy3Q5DTK1 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Chsy3Q5DTK1 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Chsy3Q5DTK1 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Chsy3Q5DTK1 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Chsy3Q5DTK1 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Chsy3Q5DTK1 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Chsy3Q5DTK1 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Chsy3Q5DTK1 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Chsy3Q5DTK1 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Chsy3Q5DTK1 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Chsy3Q5DTK1 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Chsy3Q5DTK1 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Chsy3Q5DTK1 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Chsy3Q5DTK1 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Chsy3Q5DTK1 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Chsy3Q5DTK1 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Chsy3Q5DTK1 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Chsy3Q5DTK1 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Chsy3Q5DTK1 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Chsy3Q5DTK1 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Chsy3Q5DTK1 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Chsy3Q5DTK1 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Chsy3Q5DTK1 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Chsy3Q5DTK1 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Chsy3Q5DTK1 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Chsy3Q5DTK1 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Chsy3Q5DTK1 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Chsy3Q5DTK1 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Chsy3Q5DTK1 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Chsy3Q5DTK1 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Chsy3Q5DTK1 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Chsy3Q5DTK1 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Chsy3Q5DTK1 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Chsy3Q5DTK1 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Chsy3Q5DTK1 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Chsy3Q5DTK1 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Chsy3Q5DTK1 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Chsy3Q5DTK1 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Chsy3Q5DTK1 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Chsy3Q5DTK1 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Chsy3Q5DTK1 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Chsy3Q5DTK1 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Chsy3Q5DTK1 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Chsy3Q5DTK1 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Chsy3Q5DTK1 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Chsy3Q5DTK1 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Chsy3Q5DTK1 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Chsy3Q5DTK1 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Chsy3Q5DTK1 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Chsy3Q5DTK1 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Chsy3Q5DTK1 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Chsy3Q5DTK1 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Chsy3Q5DTK1 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Chsy3Q5DTK1 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Chsy3Q5DTK1 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Chsy3Q5DTK1 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Chsy3Q5DTK1 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Chsy3Q5DTK1 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Chsy3Q5DTK1 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Chsy3Q5DTK1 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 133.3 ms