Protein–RNA interactions for Protein: Q571J5

Znf354c, Zinc finger protein 354C, mousemouse

Predictions only

Length 560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf354cQ571J5 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Znf354cQ571J5 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Znf354cQ571J5 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Znf354cQ571J5 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Znf354cQ571J5 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Znf354cQ571J5 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Znf354cQ571J5 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Znf354cQ571J5 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Znf354cQ571J5 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Znf354cQ571J5 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Znf354cQ571J5 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Znf354cQ571J5 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Znf354cQ571J5 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Znf354cQ571J5 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Znf354cQ571J5 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Znf354cQ571J5 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Znf354cQ571J5 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Znf354cQ571J5 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Znf354cQ571J5 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Znf354cQ571J5 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Znf354cQ571J5 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Znf354cQ571J5 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Znf354cQ571J5 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Znf354cQ571J5 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Znf354cQ571J5 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Znf354cQ571J5 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Znf354cQ571J5 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Znf354cQ571J5 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Znf354cQ571J5 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Znf354cQ571J5 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Znf354cQ571J5 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Znf354cQ571J5 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Znf354cQ571J5 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Znf354cQ571J5 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Znf354cQ571J5 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Znf354cQ571J5 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Znf354cQ571J5 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Znf354cQ571J5 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Znf354cQ571J5 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Znf354cQ571J5 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Znf354cQ571J5 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Znf354cQ571J5 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Znf354cQ571J5 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Znf354cQ571J5 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Znf354cQ571J5 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Znf354cQ571J5 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Znf354cQ571J5 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Znf354cQ571J5 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Znf354cQ571J5 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Znf354cQ571J5 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Znf354cQ571J5 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Znf354cQ571J5 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Znf354cQ571J5 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Znf354cQ571J5 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Znf354cQ571J5 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Znf354cQ571J5 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Znf354cQ571J5 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Znf354cQ571J5 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Znf354cQ571J5 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Znf354cQ571J5 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Znf354cQ571J5 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Znf354cQ571J5 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Znf354cQ571J5 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Znf354cQ571J5 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Znf354cQ571J5 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Znf354cQ571J5 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Znf354cQ571J5 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Znf354cQ571J5 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Znf354cQ571J5 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Znf354cQ571J5 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Znf354cQ571J5 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Znf354cQ571J5 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Znf354cQ571J5 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Znf354cQ571J5 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Znf354cQ571J5 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Znf354cQ571J5 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Znf354cQ571J5 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Znf354cQ571J5 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Znf354cQ571J5 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Znf354cQ571J5 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Znf354cQ571J5 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Znf354cQ571J5 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Znf354cQ571J5 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Znf354cQ571J5 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Znf354cQ571J5 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Znf354cQ571J5 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Znf354cQ571J5 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Znf354cQ571J5 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Znf354cQ571J5 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Znf354cQ571J5 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Znf354cQ571J5 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Znf354cQ571J5 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Znf354cQ571J5 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Znf354cQ571J5 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Znf354cQ571J5 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Znf354cQ571J5 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Znf354cQ571J5 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Znf354cQ571J5 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Znf354cQ571J5 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Znf354cQ571J5 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms