Protein–RNA interactions for Protein: Q56A10

Znf608, Zinc finger protein 608, mousemouse

Predictions only

Length 1,511 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf608Q56A10 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Znf608Q56A10 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Znf608Q56A10 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Znf608Q56A10 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
Znf608Q56A10 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Znf608Q56A10 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC29.86■■■□□ 2.37
Znf608Q56A10 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Znf608Q56A10 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
Znf608Q56A10 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
Znf608Q56A10 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Znf608Q56A10 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
Znf608Q56A10 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Znf608Q56A10 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Znf608Q56A10 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Znf608Q56A10 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Znf608Q56A10 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Znf608Q56A10 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Znf608Q56A10 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Znf608Q56A10 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Znf608Q56A10 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Znf608Q56A10 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
Znf608Q56A10 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC29.83■■■□□ 2.37
Znf608Q56A10 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC29.83■■■□□ 2.37
Znf608Q56A10 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Znf608Q56A10 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Znf608Q56A10 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Znf608Q56A10 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.37
Znf608Q56A10 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Znf608Q56A10 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
Znf608Q56A10 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC29.82■■■□□ 2.36
Znf608Q56A10 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Znf608Q56A10 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Znf608Q56A10 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
Znf608Q56A10 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Znf608Q56A10 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC29.81■■■□□ 2.36
Znf608Q56A10 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Znf608Q56A10 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Znf608Q56A10 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
Znf608Q56A10 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Znf608Q56A10 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
Znf608Q56A10 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Znf608Q56A10 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Znf608Q56A10 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
Znf608Q56A10 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Znf608Q56A10 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Znf608Q56A10 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Znf608Q56A10 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Znf608Q56A10 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Znf608Q56A10 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Znf608Q56A10 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Znf608Q56A10 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Znf608Q56A10 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Znf608Q56A10 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
Znf608Q56A10 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
Znf608Q56A10 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
Znf608Q56A10 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Znf608Q56A10 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Znf608Q56A10 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
Znf608Q56A10 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Znf608Q56A10 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Znf608Q56A10 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Znf608Q56A10 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Znf608Q56A10 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Znf608Q56A10 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
Znf608Q56A10 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Znf608Q56A10 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
Znf608Q56A10 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC29.76■■■□□ 2.35
Znf608Q56A10 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Znf608Q56A10 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Znf608Q56A10 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
Znf608Q56A10 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
Znf608Q56A10 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Znf608Q56A10 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Znf608Q56A10 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
Znf608Q56A10 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Znf608Q56A10 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Znf608Q56A10 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Znf608Q56A10 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Znf608Q56A10 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Znf608Q56A10 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Znf608Q56A10 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
Znf608Q56A10 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Znf608Q56A10 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Znf608Q56A10 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
Znf608Q56A10 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Znf608Q56A10 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC29.72■■■□□ 2.35
Znf608Q56A10 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Znf608Q56A10 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Znf608Q56A10 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Znf608Q56A10 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Znf608Q56A10 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Znf608Q56A10 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Znf608Q56A10 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
Znf608Q56A10 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Znf608Q56A10 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Znf608Q56A10 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Znf608Q56A10 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Znf608Q56A10 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Znf608Q56A10 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
Znf608Q56A10 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
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