Protein–RNA interactions for Protein: Q52KF3

Spire1, Protein spire homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spire1Q52KF3 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Spire1Q52KF3 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Spire1Q52KF3 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Spire1Q52KF3 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Spire1Q52KF3 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Spire1Q52KF3 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Spire1Q52KF3 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Spire1Q52KF3 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Spire1Q52KF3 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Spire1Q52KF3 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Spire1Q52KF3 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Spire1Q52KF3 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Spire1Q52KF3 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Spire1Q52KF3 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Spire1Q52KF3 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Spire1Q52KF3 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Spire1Q52KF3 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Spire1Q52KF3 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Spire1Q52KF3 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Spire1Q52KF3 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Spire1Q52KF3 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Spire1Q52KF3 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Spire1Q52KF3 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Spire1Q52KF3 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Spire1Q52KF3 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Spire1Q52KF3 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Spire1Q52KF3 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Spire1Q52KF3 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Spire1Q52KF3 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Spire1Q52KF3 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Spire1Q52KF3 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Spire1Q52KF3 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Spire1Q52KF3 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Spire1Q52KF3 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Spire1Q52KF3 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Spire1Q52KF3 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Spire1Q52KF3 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Spire1Q52KF3 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Spire1Q52KF3 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Spire1Q52KF3 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Spire1Q52KF3 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Spire1Q52KF3 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Spire1Q52KF3 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Spire1Q52KF3 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Spire1Q52KF3 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Spire1Q52KF3 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Spire1Q52KF3 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Spire1Q52KF3 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Spire1Q52KF3 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Spire1Q52KF3 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Spire1Q52KF3 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Spire1Q52KF3 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Spire1Q52KF3 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Spire1Q52KF3 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Spire1Q52KF3 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Spire1Q52KF3 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Spire1Q52KF3 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Spire1Q52KF3 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Spire1Q52KF3 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Spire1Q52KF3 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Spire1Q52KF3 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Spire1Q52KF3 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Spire1Q52KF3 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Spire1Q52KF3 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Spire1Q52KF3 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Spire1Q52KF3 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Spire1Q52KF3 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Spire1Q52KF3 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Spire1Q52KF3 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Spire1Q52KF3 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Spire1Q52KF3 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Spire1Q52KF3 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Spire1Q52KF3 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Spire1Q52KF3 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Spire1Q52KF3 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Spire1Q52KF3 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Spire1Q52KF3 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Spire1Q52KF3 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Spire1Q52KF3 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Spire1Q52KF3 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Spire1Q52KF3 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Spire1Q52KF3 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
Spire1Q52KF3 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Spire1Q52KF3 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Spire1Q52KF3 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Spire1Q52KF3 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Spire1Q52KF3 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Spire1Q52KF3 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Spire1Q52KF3 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Spire1Q52KF3 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Spire1Q52KF3 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Spire1Q52KF3 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Spire1Q52KF3 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Spire1Q52KF3 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Spire1Q52KF3 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Spire1Q52KF3 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Spire1Q52KF3 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Spire1Q52KF3 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Spire1Q52KF3 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Spire1Q52KF3 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms