Protein–RNA interactions for Protein: Q4VA36

Ccdc84, Coiled-coil domain-containing protein 84, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc84Q4VA36 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc84Q4VA36 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc84Q4VA36 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc84Q4VA36 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc84Q4VA36 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc84Q4VA36 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ccdc84Q4VA36 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ccdc84Q4VA36 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ccdc84Q4VA36 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc84Q4VA36 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc84Q4VA36 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc84Q4VA36 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc84Q4VA36 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc84Q4VA36 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc84Q4VA36 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc84Q4VA36 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc84Q4VA36 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc84Q4VA36 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc84Q4VA36 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc84Q4VA36 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc84Q4VA36 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc84Q4VA36 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc84Q4VA36 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc84Q4VA36 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc84Q4VA36 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc84Q4VA36 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc84Q4VA36 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc84Q4VA36 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc84Q4VA36 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc84Q4VA36 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc84Q4VA36 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc84Q4VA36 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc84Q4VA36 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc84Q4VA36 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc84Q4VA36 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc84Q4VA36 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc84Q4VA36 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc84Q4VA36 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc84Q4VA36 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc84Q4VA36 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc84Q4VA36 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc84Q4VA36 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc84Q4VA36 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc84Q4VA36 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc84Q4VA36 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc84Q4VA36 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc84Q4VA36 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc84Q4VA36 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc84Q4VA36 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc84Q4VA36 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc84Q4VA36 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc84Q4VA36 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc84Q4VA36 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc84Q4VA36 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc84Q4VA36 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc84Q4VA36 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc84Q4VA36 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc84Q4VA36 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc84Q4VA36 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc84Q4VA36 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc84Q4VA36 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc84Q4VA36 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc84Q4VA36 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc84Q4VA36 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc84Q4VA36 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc84Q4VA36 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc84Q4VA36 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc84Q4VA36 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc84Q4VA36 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc84Q4VA36 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc84Q4VA36 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc84Q4VA36 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc84Q4VA36 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc84Q4VA36 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc84Q4VA36 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc84Q4VA36 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc84Q4VA36 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc84Q4VA36 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc84Q4VA36 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc84Q4VA36 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc84Q4VA36 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc84Q4VA36 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc84Q4VA36 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc84Q4VA36 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc84Q4VA36 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc84Q4VA36 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc84Q4VA36 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc84Q4VA36 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc84Q4VA36 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc84Q4VA36 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc84Q4VA36 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc84Q4VA36 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc84Q4VA36 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc84Q4VA36 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc84Q4VA36 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc84Q4VA36 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc84Q4VA36 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc84Q4VA36 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc84Q4VA36 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc84Q4VA36 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms