Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDG0

Slc27a5, Bile acyl-CoA synthetase, mousemouse

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Length 689 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc27a5Q4LDG0 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Slc27a5Q4LDG0 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Slc27a5Q4LDG0 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Slc27a5Q4LDG0 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Slc27a5Q4LDG0 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Slc27a5Q4LDG0 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Slc27a5Q4LDG0 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Slc27a5Q4LDG0 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Slc27a5Q4LDG0 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Slc27a5Q4LDG0 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Slc27a5Q4LDG0 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Slc27a5Q4LDG0 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Slc27a5Q4LDG0 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Slc27a5Q4LDG0 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Slc27a5Q4LDG0 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Slc27a5Q4LDG0 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Slc27a5Q4LDG0 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Slc27a5Q4LDG0 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Slc27a5Q4LDG0 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Slc27a5Q4LDG0 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Slc27a5Q4LDG0 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Slc27a5Q4LDG0 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Slc27a5Q4LDG0 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Slc27a5Q4LDG0 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Slc27a5Q4LDG0 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Slc27a5Q4LDG0 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Slc27a5Q4LDG0 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Slc27a5Q4LDG0 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Slc27a5Q4LDG0 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Slc27a5Q4LDG0 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Slc27a5Q4LDG0 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Slc27a5Q4LDG0 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Slc27a5Q4LDG0 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Slc27a5Q4LDG0 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Slc27a5Q4LDG0 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Slc27a5Q4LDG0 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Slc27a5Q4LDG0 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Slc27a5Q4LDG0 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Slc27a5Q4LDG0 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Slc27a5Q4LDG0 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Slc27a5Q4LDG0 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Slc27a5Q4LDG0 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Slc27a5Q4LDG0 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Slc27a5Q4LDG0 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Slc27a5Q4LDG0 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Slc27a5Q4LDG0 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Slc27a5Q4LDG0 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Slc27a5Q4LDG0 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Slc27a5Q4LDG0 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Slc27a5Q4LDG0 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Slc27a5Q4LDG0 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Slc27a5Q4LDG0 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Slc27a5Q4LDG0 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Slc27a5Q4LDG0 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Slc27a5Q4LDG0 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Slc27a5Q4LDG0 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Slc27a5Q4LDG0 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Slc27a5Q4LDG0 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Slc27a5Q4LDG0 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Slc27a5Q4LDG0 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Slc27a5Q4LDG0 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Slc27a5Q4LDG0 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Slc27a5Q4LDG0 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Slc27a5Q4LDG0 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Slc27a5Q4LDG0 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Slc27a5Q4LDG0 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Slc27a5Q4LDG0 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Slc27a5Q4LDG0 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Slc27a5Q4LDG0 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Slc27a5Q4LDG0 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Slc27a5Q4LDG0 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Slc27a5Q4LDG0 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Slc27a5Q4LDG0 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Slc27a5Q4LDG0 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Slc27a5Q4LDG0 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Slc27a5Q4LDG0 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Slc27a5Q4LDG0 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Slc27a5Q4LDG0 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Slc27a5Q4LDG0 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Slc27a5Q4LDG0 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Slc27a5Q4LDG0 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Slc27a5Q4LDG0 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Slc27a5Q4LDG0 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Slc27a5Q4LDG0 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Slc27a5Q4LDG0 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Slc27a5Q4LDG0 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Slc27a5Q4LDG0 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Slc27a5Q4LDG0 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Slc27a5Q4LDG0 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Slc27a5Q4LDG0 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Slc27a5Q4LDG0 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Slc27a5Q4LDG0 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Slc27a5Q4LDG0 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Slc27a5Q4LDG0 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Slc27a5Q4LDG0 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Slc27a5Q4LDG0 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Slc27a5Q4LDG0 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Slc27a5Q4LDG0 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Slc27a5Q4LDG0 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Slc27a5Q4LDG0 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms