Protein–RNA interactions for Protein: Q4FZF3

Ddx49, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX49, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx49Q4FZF3 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ddx49Q4FZF3 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ddx49Q4FZF3 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ddx49Q4FZF3 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ddx49Q4FZF3 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ddx49Q4FZF3 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ddx49Q4FZF3 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ddx49Q4FZF3 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ddx49Q4FZF3 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Ddx49Q4FZF3 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ddx49Q4FZF3 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Ddx49Q4FZF3 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ddx49Q4FZF3 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Ddx49Q4FZF3 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ddx49Q4FZF3 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ddx49Q4FZF3 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ddx49Q4FZF3 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ddx49Q4FZF3 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ddx49Q4FZF3 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ddx49Q4FZF3 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ddx49Q4FZF3 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Ddx49Q4FZF3 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ddx49Q4FZF3 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ddx49Q4FZF3 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ddx49Q4FZF3 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Ddx49Q4FZF3 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ddx49Q4FZF3 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ddx49Q4FZF3 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ddx49Q4FZF3 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ddx49Q4FZF3 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ddx49Q4FZF3 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ddx49Q4FZF3 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ddx49Q4FZF3 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ddx49Q4FZF3 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ddx49Q4FZF3 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ddx49Q4FZF3 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ddx49Q4FZF3 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ddx49Q4FZF3 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ddx49Q4FZF3 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Ddx49Q4FZF3 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ddx49Q4FZF3 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ddx49Q4FZF3 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ddx49Q4FZF3 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ddx49Q4FZF3 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ddx49Q4FZF3 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ddx49Q4FZF3 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ddx49Q4FZF3 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ddx49Q4FZF3 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ddx49Q4FZF3 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ddx49Q4FZF3 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ddx49Q4FZF3 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
Ddx49Q4FZF3 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ddx49Q4FZF3 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ddx49Q4FZF3 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ddx49Q4FZF3 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ddx49Q4FZF3 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ddx49Q4FZF3 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ddx49Q4FZF3 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ddx49Q4FZF3 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ddx49Q4FZF3 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ddx49Q4FZF3 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ddx49Q4FZF3 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ddx49Q4FZF3 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ddx49Q4FZF3 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ddx49Q4FZF3 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ddx49Q4FZF3 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ddx49Q4FZF3 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ddx49Q4FZF3 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ddx49Q4FZF3 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ddx49Q4FZF3 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ddx49Q4FZF3 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ddx49Q4FZF3 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ddx49Q4FZF3 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ddx49Q4FZF3 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ddx49Q4FZF3 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ddx49Q4FZF3 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ddx49Q4FZF3 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ddx49Q4FZF3 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ddx49Q4FZF3 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ddx49Q4FZF3 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ddx49Q4FZF3 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ddx49Q4FZF3 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ddx49Q4FZF3 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ddx49Q4FZF3 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ddx49Q4FZF3 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ddx49Q4FZF3 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ddx49Q4FZF3 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ddx49Q4FZF3 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ddx49Q4FZF3 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Ddx49Q4FZF3 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ddx49Q4FZF3 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ddx49Q4FZF3 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Ddx49Q4FZF3 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ddx49Q4FZF3 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ddx49Q4FZF3 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ddx49Q4FZF3 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Ddx49Q4FZF3 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ddx49Q4FZF3 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ddx49Q4FZF3 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ddx49Q4FZF3 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58 ms