Protein–RNA interactions for Protein: Q4ACU6

Shank3, SH3 and multiple ankyrin repeat domains protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,730 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shank3Q4ACU6 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
Shank3Q4ACU6 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
Shank3Q4ACU6 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Shank3Q4ACU6 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Shank3Q4ACU6 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Shank3Q4ACU6 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Shank3Q4ACU6 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Shank3Q4ACU6 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Shank3Q4ACU6 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Shank3Q4ACU6 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Shank3Q4ACU6 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Shank3Q4ACU6 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Shank3Q4ACU6 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Shank3Q4ACU6 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Shank3Q4ACU6 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Shank3Q4ACU6 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Shank3Q4ACU6 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Shank3Q4ACU6 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Shank3Q4ACU6 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Shank3Q4ACU6 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Shank3Q4ACU6 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Shank3Q4ACU6 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Shank3Q4ACU6 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Shank3Q4ACU6 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Shank3Q4ACU6 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Shank3Q4ACU6 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Shank3Q4ACU6 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Shank3Q4ACU6 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Shank3Q4ACU6 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Shank3Q4ACU6 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Shank3Q4ACU6 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Shank3Q4ACU6 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Shank3Q4ACU6 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Shank3Q4ACU6 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Shank3Q4ACU6 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Shank3Q4ACU6 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Shank3Q4ACU6 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Shank3Q4ACU6 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Shank3Q4ACU6 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Shank3Q4ACU6 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Shank3Q4ACU6 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Shank3Q4ACU6 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Shank3Q4ACU6 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Shank3Q4ACU6 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Shank3Q4ACU6 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Shank3Q4ACU6 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Shank3Q4ACU6 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Shank3Q4ACU6 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Shank3Q4ACU6 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Shank3Q4ACU6 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
Shank3Q4ACU6 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Shank3Q4ACU6 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Shank3Q4ACU6 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Shank3Q4ACU6 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Shank3Q4ACU6 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Shank3Q4ACU6 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Shank3Q4ACU6 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Shank3Q4ACU6 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Shank3Q4ACU6 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Shank3Q4ACU6 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Shank3Q4ACU6 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Shank3Q4ACU6 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Shank3Q4ACU6 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Shank3Q4ACU6 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Shank3Q4ACU6 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Shank3Q4ACU6 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Shank3Q4ACU6 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Shank3Q4ACU6 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Shank3Q4ACU6 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Shank3Q4ACU6 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Shank3Q4ACU6 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Shank3Q4ACU6 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Shank3Q4ACU6 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Shank3Q4ACU6 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Shank3Q4ACU6 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Shank3Q4ACU6 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Shank3Q4ACU6 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Shank3Q4ACU6 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Shank3Q4ACU6 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Shank3Q4ACU6 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Shank3Q4ACU6 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Shank3Q4ACU6 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Shank3Q4ACU6 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Shank3Q4ACU6 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Shank3Q4ACU6 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Shank3Q4ACU6 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Shank3Q4ACU6 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Shank3Q4ACU6 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Shank3Q4ACU6 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Shank3Q4ACU6 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Shank3Q4ACU6 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Shank3Q4ACU6 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Shank3Q4ACU6 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Shank3Q4ACU6 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Shank3Q4ACU6 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Shank3Q4ACU6 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Shank3Q4ACU6 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Shank3Q4ACU6 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Shank3Q4ACU6 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Shank3Q4ACU6 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms