Protein–RNA interactions for Protein: Q499D0

Foxn3, Forkhead box protein N3, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxn3Q499D0 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Foxn3Q499D0 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Foxn3Q499D0 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Foxn3Q499D0 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Foxn3Q499D0 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Foxn3Q499D0 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Foxn3Q499D0 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Foxn3Q499D0 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Foxn3Q499D0 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Foxn3Q499D0 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Foxn3Q499D0 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Foxn3Q499D0 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Foxn3Q499D0 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Foxn3Q499D0 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Foxn3Q499D0 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Foxn3Q499D0 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Foxn3Q499D0 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Foxn3Q499D0 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Foxn3Q499D0 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Foxn3Q499D0 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Foxn3Q499D0 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Foxn3Q499D0 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Foxn3Q499D0 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Foxn3Q499D0 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Foxn3Q499D0 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Foxn3Q499D0 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Foxn3Q499D0 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Foxn3Q499D0 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Foxn3Q499D0 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Foxn3Q499D0 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Foxn3Q499D0 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Foxn3Q499D0 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Foxn3Q499D0 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Foxn3Q499D0 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Foxn3Q499D0 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Foxn3Q499D0 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Foxn3Q499D0 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Foxn3Q499D0 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Foxn3Q499D0 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Foxn3Q499D0 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Foxn3Q499D0 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Foxn3Q499D0 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Foxn3Q499D0 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Foxn3Q499D0 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Foxn3Q499D0 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Foxn3Q499D0 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Foxn3Q499D0 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Foxn3Q499D0 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Foxn3Q499D0 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Foxn3Q499D0 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Foxn3Q499D0 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Foxn3Q499D0 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Foxn3Q499D0 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Foxn3Q499D0 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Foxn3Q499D0 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Foxn3Q499D0 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Foxn3Q499D0 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Foxn3Q499D0 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Foxn3Q499D0 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Foxn3Q499D0 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Foxn3Q499D0 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Foxn3Q499D0 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Foxn3Q499D0 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Foxn3Q499D0 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Foxn3Q499D0 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Foxn3Q499D0 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Foxn3Q499D0 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Foxn3Q499D0 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Foxn3Q499D0 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Foxn3Q499D0 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Foxn3Q499D0 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Foxn3Q499D0 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Foxn3Q499D0 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Foxn3Q499D0 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Foxn3Q499D0 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Foxn3Q499D0 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Foxn3Q499D0 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Foxn3Q499D0 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Foxn3Q499D0 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Foxn3Q499D0 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Foxn3Q499D0 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Foxn3Q499D0 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Foxn3Q499D0 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Foxn3Q499D0 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Foxn3Q499D0 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Foxn3Q499D0 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Foxn3Q499D0 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Foxn3Q499D0 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Foxn3Q499D0 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Foxn3Q499D0 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Foxn3Q499D0 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Foxn3Q499D0 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Foxn3Q499D0 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Foxn3Q499D0 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Foxn3Q499D0 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Foxn3Q499D0 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Foxn3Q499D0 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Foxn3Q499D0 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Foxn3Q499D0 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Foxn3Q499D0 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms