Protein–RNA interactions for Protein: Q3V3Q4

Pydc3, Pyrin domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pydc3Q3V3Q4 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pydc3Q3V3Q4 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pydc3Q3V3Q4 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pydc3Q3V3Q4 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pydc3Q3V3Q4 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pydc3Q3V3Q4 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pydc3Q3V3Q4 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pydc3Q3V3Q4 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pydc3Q3V3Q4 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pydc3Q3V3Q4 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pydc3Q3V3Q4 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pydc3Q3V3Q4 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pydc3Q3V3Q4 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pydc3Q3V3Q4 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pydc3Q3V3Q4 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pydc3Q3V3Q4 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pydc3Q3V3Q4 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pydc3Q3V3Q4 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Pydc3Q3V3Q4 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pydc3Q3V3Q4 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Pydc3Q3V3Q4 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pydc3Q3V3Q4 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pydc3Q3V3Q4 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pydc3Q3V3Q4 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pydc3Q3V3Q4 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pydc3Q3V3Q4 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pydc3Q3V3Q4 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pydc3Q3V3Q4 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pydc3Q3V3Q4 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pydc3Q3V3Q4 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pydc3Q3V3Q4 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pydc3Q3V3Q4 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pydc3Q3V3Q4 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pydc3Q3V3Q4 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pydc3Q3V3Q4 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pydc3Q3V3Q4 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pydc3Q3V3Q4 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pydc3Q3V3Q4 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pydc3Q3V3Q4 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pydc3Q3V3Q4 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pydc3Q3V3Q4 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pydc3Q3V3Q4 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pydc3Q3V3Q4 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pydc3Q3V3Q4 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pydc3Q3V3Q4 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Pydc3Q3V3Q4 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pydc3Q3V3Q4 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Pydc3Q3V3Q4 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Pydc3Q3V3Q4 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pydc3Q3V3Q4 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pydc3Q3V3Q4 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pydc3Q3V3Q4 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Pydc3Q3V3Q4 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pydc3Q3V3Q4 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pydc3Q3V3Q4 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pydc3Q3V3Q4 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pydc3Q3V3Q4 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pydc3Q3V3Q4 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pydc3Q3V3Q4 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pydc3Q3V3Q4 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pydc3Q3V3Q4 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pydc3Q3V3Q4 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pydc3Q3V3Q4 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pydc3Q3V3Q4 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pydc3Q3V3Q4 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pydc3Q3V3Q4 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pydc3Q3V3Q4 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pydc3Q3V3Q4 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pydc3Q3V3Q4 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pydc3Q3V3Q4 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pydc3Q3V3Q4 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pydc3Q3V3Q4 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pydc3Q3V3Q4 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pydc3Q3V3Q4 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pydc3Q3V3Q4 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pydc3Q3V3Q4 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pydc3Q3V3Q4 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pydc3Q3V3Q4 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Pydc3Q3V3Q4 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pydc3Q3V3Q4 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pydc3Q3V3Q4 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pydc3Q3V3Q4 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pydc3Q3V3Q4 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pydc3Q3V3Q4 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pydc3Q3V3Q4 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pydc3Q3V3Q4 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pydc3Q3V3Q4 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Pydc3Q3V3Q4 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pydc3Q3V3Q4 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pydc3Q3V3Q4 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pydc3Q3V3Q4 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pydc3Q3V3Q4 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pydc3Q3V3Q4 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pydc3Q3V3Q4 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pydc3Q3V3Q4 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pydc3Q3V3Q4 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pydc3Q3V3Q4 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pydc3Q3V3Q4 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Pydc3Q3V3Q4 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pydc3Q3V3Q4 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms