Protein–RNA interactions for Protein: Q3V1H9

Samd5, Sterile alpha motif domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd5Q3V1H9 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Samd5Q3V1H9 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Samd5Q3V1H9 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Samd5Q3V1H9 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Samd5Q3V1H9 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Samd5Q3V1H9 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Samd5Q3V1H9 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Samd5Q3V1H9 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Samd5Q3V1H9 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Samd5Q3V1H9 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Samd5Q3V1H9 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Samd5Q3V1H9 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Samd5Q3V1H9 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Samd5Q3V1H9 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Samd5Q3V1H9 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Samd5Q3V1H9 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Samd5Q3V1H9 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Samd5Q3V1H9 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Samd5Q3V1H9 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Samd5Q3V1H9 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Samd5Q3V1H9 Gm37444-201ENSMUST00000193605 439 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Samd5Q3V1H9 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Samd5Q3V1H9 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Samd5Q3V1H9 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Samd5Q3V1H9 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Samd5Q3V1H9 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Samd5Q3V1H9 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Samd5Q3V1H9 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Samd5Q3V1H9 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Samd5Q3V1H9 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Samd5Q3V1H9 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Samd5Q3V1H9 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Samd5Q3V1H9 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Samd5Q3V1H9 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Samd5Q3V1H9 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Samd5Q3V1H9 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Samd5Q3V1H9 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Samd5Q3V1H9 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Samd5Q3V1H9 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Samd5Q3V1H9 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Samd5Q3V1H9 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Samd5Q3V1H9 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Samd5Q3V1H9 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Samd5Q3V1H9 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Samd5Q3V1H9 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Samd5Q3V1H9 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Samd5Q3V1H9 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Samd5Q3V1H9 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Samd5Q3V1H9 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Samd5Q3V1H9 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Samd5Q3V1H9 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Samd5Q3V1H9 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Samd5Q3V1H9 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Samd5Q3V1H9 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Samd5Q3V1H9 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Samd5Q3V1H9 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Samd5Q3V1H9 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Samd5Q3V1H9 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Samd5Q3V1H9 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Samd5Q3V1H9 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Samd5Q3V1H9 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Samd5Q3V1H9 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Samd5Q3V1H9 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Samd5Q3V1H9 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Samd5Q3V1H9 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Samd5Q3V1H9 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Samd5Q3V1H9 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Samd5Q3V1H9 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Samd5Q3V1H9 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Samd5Q3V1H9 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Samd5Q3V1H9 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Samd5Q3V1H9 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Samd5Q3V1H9 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Samd5Q3V1H9 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Samd5Q3V1H9 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Samd5Q3V1H9 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Samd5Q3V1H9 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Samd5Q3V1H9 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Samd5Q3V1H9 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Samd5Q3V1H9 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Samd5Q3V1H9 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Samd5Q3V1H9 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Samd5Q3V1H9 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Samd5Q3V1H9 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Samd5Q3V1H9 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Samd5Q3V1H9 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Samd5Q3V1H9 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Samd5Q3V1H9 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Samd5Q3V1H9 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Samd5Q3V1H9 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Samd5Q3V1H9 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Samd5Q3V1H9 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Samd5Q3V1H9 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Samd5Q3V1H9 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Samd5Q3V1H9 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Samd5Q3V1H9 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Samd5Q3V1H9 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Samd5Q3V1H9 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Samd5Q3V1H9 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Samd5Q3V1H9 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms