Protein–RNA interactions for Protein: Q3V1H1

Ckap2, Cytoskeleton-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap2Q3V1H1 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ckap2Q3V1H1 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ckap2Q3V1H1 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ckap2Q3V1H1 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ckap2Q3V1H1 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Ckap2Q3V1H1 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ckap2Q3V1H1 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ckap2Q3V1H1 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ckap2Q3V1H1 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ckap2Q3V1H1 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ckap2Q3V1H1 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ckap2Q3V1H1 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ckap2Q3V1H1 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ckap2Q3V1H1 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ckap2Q3V1H1 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ckap2Q3V1H1 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ckap2Q3V1H1 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ckap2Q3V1H1 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ckap2Q3V1H1 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ckap2Q3V1H1 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ckap2Q3V1H1 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ckap2Q3V1H1 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ckap2Q3V1H1 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ckap2Q3V1H1 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ckap2Q3V1H1 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ckap2Q3V1H1 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ckap2Q3V1H1 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Ckap2Q3V1H1 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ckap2Q3V1H1 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ckap2Q3V1H1 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ckap2Q3V1H1 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ckap2Q3V1H1 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ckap2Q3V1H1 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ckap2Q3V1H1 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ckap2Q3V1H1 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ckap2Q3V1H1 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Ckap2Q3V1H1 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ckap2Q3V1H1 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ckap2Q3V1H1 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ckap2Q3V1H1 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ckap2Q3V1H1 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ckap2Q3V1H1 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ckap2Q3V1H1 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ckap2Q3V1H1 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ckap2Q3V1H1 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ckap2Q3V1H1 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Ckap2Q3V1H1 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ckap2Q3V1H1 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ckap2Q3V1H1 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ckap2Q3V1H1 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ckap2Q3V1H1 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ckap2Q3V1H1 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ckap2Q3V1H1 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ckap2Q3V1H1 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ckap2Q3V1H1 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ckap2Q3V1H1 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ckap2Q3V1H1 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ckap2Q3V1H1 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ckap2Q3V1H1 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ckap2Q3V1H1 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ckap2Q3V1H1 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Ckap2Q3V1H1 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Ckap2Q3V1H1 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ckap2Q3V1H1 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ckap2Q3V1H1 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ckap2Q3V1H1 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ckap2Q3V1H1 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ckap2Q3V1H1 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ckap2Q3V1H1 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ckap2Q3V1H1 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ckap2Q3V1H1 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ckap2Q3V1H1 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ckap2Q3V1H1 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ckap2Q3V1H1 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ckap2Q3V1H1 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ckap2Q3V1H1 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ckap2Q3V1H1 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Ckap2Q3V1H1 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ckap2Q3V1H1 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ckap2Q3V1H1 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ckap2Q3V1H1 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ckap2Q3V1H1 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ckap2Q3V1H1 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ckap2Q3V1H1 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ckap2Q3V1H1 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ckap2Q3V1H1 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ckap2Q3V1H1 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ckap2Q3V1H1 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ckap2Q3V1H1 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ckap2Q3V1H1 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ckap2Q3V1H1 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ckap2Q3V1H1 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ckap2Q3V1H1 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ckap2Q3V1H1 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ckap2Q3V1H1 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ckap2Q3V1H1 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ckap2Q3V1H1 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ckap2Q3V1H1 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ckap2Q3V1H1 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ckap2Q3V1H1 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms