Protein–RNA interactions for Protein: Q3V129

Ulk4, Serine/threonine-protein kinase ULK4, mousemouse

Predictions only

Length 1,303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ulk4Q3V129 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ulk4Q3V129 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ulk4Q3V129 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ulk4Q3V129 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ulk4Q3V129 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ulk4Q3V129 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ulk4Q3V129 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ulk4Q3V129 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ulk4Q3V129 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ulk4Q3V129 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ulk4Q3V129 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ulk4Q3V129 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ulk4Q3V129 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ulk4Q3V129 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ulk4Q3V129 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Ulk4Q3V129 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ulk4Q3V129 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ulk4Q3V129 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ulk4Q3V129 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ulk4Q3V129 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Ulk4Q3V129 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ulk4Q3V129 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Ulk4Q3V129 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Ulk4Q3V129 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ulk4Q3V129 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ulk4Q3V129 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ulk4Q3V129 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ulk4Q3V129 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ulk4Q3V129 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ulk4Q3V129 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ulk4Q3V129 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ulk4Q3V129 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ulk4Q3V129 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ulk4Q3V129 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ulk4Q3V129 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ulk4Q3V129 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ulk4Q3V129 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ulk4Q3V129 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ulk4Q3V129 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Ulk4Q3V129 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Ulk4Q3V129 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ulk4Q3V129 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ulk4Q3V129 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ulk4Q3V129 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ulk4Q3V129 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ulk4Q3V129 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ulk4Q3V129 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ulk4Q3V129 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ulk4Q3V129 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ulk4Q3V129 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ulk4Q3V129 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ulk4Q3V129 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Ulk4Q3V129 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ulk4Q3V129 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Ulk4Q3V129 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ulk4Q3V129 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ulk4Q3V129 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ulk4Q3V129 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ulk4Q3V129 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ulk4Q3V129 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ulk4Q3V129 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ulk4Q3V129 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ulk4Q3V129 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ulk4Q3V129 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ulk4Q3V129 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ulk4Q3V129 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Ulk4Q3V129 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ulk4Q3V129 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ulk4Q3V129 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ulk4Q3V129 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ulk4Q3V129 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ulk4Q3V129 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ulk4Q3V129 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ulk4Q3V129 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ulk4Q3V129 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ulk4Q3V129 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ulk4Q3V129 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ulk4Q3V129 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ulk4Q3V129 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ulk4Q3V129 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ulk4Q3V129 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ulk4Q3V129 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ulk4Q3V129 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ulk4Q3V129 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ulk4Q3V129 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ulk4Q3V129 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ulk4Q3V129 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ulk4Q3V129 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ulk4Q3V129 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ulk4Q3V129 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ulk4Q3V129 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ulk4Q3V129 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ulk4Q3V129 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ulk4Q3V129 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ulk4Q3V129 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ulk4Q3V129 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ulk4Q3V129 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ulk4Q3V129 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ulk4Q3V129 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ulk4Q3V129 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms